Záručný fond, ktorý sa realizuje ako súčasť nekonkurenčného projektu, ponúkne finančným inštitúciám (úverovým bankám) záruky, ktoré poskytujú kapitál podnikateľom na ich inovačné činnosti vrátane realizácie výsledkov výskumu a vývoja. Prevzatie značnej časti rizika, ktoré znášajú finančné inštitúcie, zo strany záručného fondu vytvorí stimul na zapojenie súkromného kapitálu do financovania inovačných projektov. Z operácie sa takisto poskytne podpora vo forme dotácií na úroky z úverov v súlade s článkom 37 ods. 7 nariadenia č. 1303/2013.