Úlohy, ktoré sa majú realizovať v priebehu projektu: Malé špecializované bunky zohrávajú rozhodujúcu úlohu pri mnohých chorobách, ako sú nádorové kmeňové bunky alebo kmeňové bunky pri progresii rakovinových procesov. Cytostatická terapia v prežívajúcich rakovinových bunkách je známe, že zvyšuje expresiu transkripčných faktorov nádorových kmeňových buniek, ktoré hrajú rozhodujúcu úlohu vo vývoji cytostatickej rezistencie, metastáz a zníženej účinnosti liečby. Preto má vývoj nádorových kmeňových buniek alebo buniek podobných kmeňovým bunkám veľký vplyv na šance pacientov na prežitie. Existujú však technické prekážky pre štúdium týchto malých počtov špeciálnych buniek, ak si detekcia malých množstiev vyžaduje špeciálny súbor zariadení. Na druhej strane si príslušné štúdie vyžadujú aj dostupnosť špecializovaného systému vybavenia, kontrolu kvality sterilných podmienok a prepravných trás. To odôvodňuje potrebu zriadiť špecializované výskumné centrum v PTE, ktoré by oddelilo tento malý počet špeciálnych buniek a následne sa dozvedelo o ich vlastnostiach. Vplyv mitochondrimu na vyjadrenie markerov kmeňových buniek. Vysoká čistota separácia nádorových kmeňových buniek alebo kmeňových buniek podobných bunkám sa vykonáva prietokomerom, triediacim systémom buniek, metabolické štúdie sa vykonávajú s Seahorse a analýza izolovaných malých množstiev existujúcich buniek sa vykonáva v sterilných podmienkach (napr. vyšetrenie zmien dlhodobej mitochondriálnej funkcie) pomocou fluorescenčného mikroskopu (ImageXpress Micro XLS High Content Screening system) pripojeného k termostatu CO2. Mikročastice a fragmenty plazmatickej membrány uvoľnené z rakovinových buniek v dôsledku cytostatickej terapie sú spojené s bunkovou smrťou a bunkovými transformáciami, ktoré poskytujú nové informácie o účinkoch bunkovej smrti cytostatík. Tieto štúdie odhaľujú úlohu mitochondium pri preprogramovaní cytostatickej indukovanej rakovinových kmeňových buniek alebo kmeňových buniek podobných bunkám a prispievajú k pochopeniu možností mitochondriálnej regulácie. Vplyv zmien mitochondriovej funkcie na zmeny expresného profilu nádorových kmeňových buniek alebo kmeňových buniek. Reprodukovateľnú izoláciu RNA a DNA zo skromných buniek vykonáva AS4500 Maxwell RSC System DNA RNA a analýza kvality RNA sa vykonáva pomocou špeciálneho zariadenia Agilent 2100 Bioanalyzer pre profil mRNA. Profil mRNA sa meria buď systémom Illumina MiniSeq alebo systémom Affimetrix array, validácia výsledkov je účinok preprogramovania rakovinových buniek do kmeňových buniek. Okrem toho tieto zlepšenia umožňujú analyzovať zmeny v profiloch výrazov, ktoré môžu poskytnúť informácie o tom, ako odstrániť profil expresie typický pre nádorové kmeňové bunky. Okrem toho budeme skúmať vývoj mutácií vyvolaných cytostatickou terapiou, proces, ktorý má prvoradý význam pri tvorbe nádoru a prenosu, ktorý je testovaný s 384 otvorom qPCR systémom. Na základe týchto údajov môžeme určiť mitochondriálne prenosové cesty, ktoré vedú k mitochondiálnej regulácii génových expresií. Možnosť ovládania mitochondriálnych stavov a membránového potenciálu pomocou syntetických malých molekúl. Niekoľko publikácií ukázalo, že mitochondriá tiež hrajú dôležitú úlohu pri udržiavaní charakteru kmeňových buniek rakovinových buniek, čím sa zvyšuje možnosť, že zmena mitochondriálneho membránového potenciálu prostredníctvom molekúl nasmerovaných na mitochondrium by mohla zmeniť charakter kmeňových buniek rakovinových buniek. V našich predchádzajúcich štúdiách už bolo uvedené, že molekuly nasmerované na mitochondrium majú pozitívny vplyv na rakovinové bunky, konkrétne posun signalizačných procesov smerom k bunkovej smrti. Tieto údaje naznačujú potenciálnu úlohu molekúl riadených mitochondriom pri eliminácii cytostatickej rezistencie, ako sú fosfónové soli spojené s N-oxylpyrrolidínom. V tejto oblasti máme skúsenosti z výskumu, ktoré nám umožnia úspešne sa pokúsiť o syntézu nových typov konjugátov obsahujúcich oba štrukturálne prvky. Tieto štúdie môžu preukázať chemický potenciál, prostredníctvom ktorého môžu byť rakovinové bunky zničené predtým, ako sa rakovina vyvinie do kmeňových buniek. Ďalší rozvoj syntetického chemického potenciálu, syntéza molekúl nasmerovaných do mitochondria. Cieľové zlúčeniny, ktoré spôsobujú destabilizáciu mitochondrium, zahŕňajú niekoľko funkčných karboxylových acidamidov, laktámov, aldehydu, malej molárnej hmoty Kiral zlúčenín, chirálnych stavebných blokov, ktorých syntézu možno dosiahnuť vopred. Tapa získaný v oblasti syntézy heterocyklických zlúčenín po celé desaťročia
