Cieľom projektu je výskum patogenézy zriedkavých chorôb novými diagnostickými metódami, ktoré samy osebe predstavujú posun paradigmy a pridanú hodnotu, pretože technologický pokrok zásadne zmenil diagnostickú účinnosť v tejto oblasti. V súlade s cieľmi Medzinárodného konzorcia zriedkavých chorôb a prostredníctvom organizácie spolupráce v oblasti excelentnosti je cieľom projektu pokračovať v liečbe. Jednou z hlavných noviniek tohto výskumného programu je, že prostredníctvom synergickej koordinácie maďarskej špičkovej výskumnej kapacity vytvára pre zákazníka príležitosť ďalej sa podieľať na domácej a medzinárodnej spolupráci, publikovať v popredných časopisoch (kvalita Q1, D1) v tejto oblasti a vytvoriť celý rad nových výskumno-vývojových trendov. Výsledky poskytnú medzinárodne jedinečnú príležitosť pochopiť patogenézu zriedkavých chorôb, rozvíjať nové diagnostické a terapeutické postupy, dlhodobo ich integrovať do kliniky a tým zabezpečiť dlhodobú udržateľnosť výsledkov. Vyvíja sa maďarská klinická exom databanka, ktorá je nevyhnutná pre návrh individualizovanej diagnostiky a liečenia, ako aj pre návrh moderného základného a farmaceutického výskumu založeného na genetickom základe. V súlade s vyššie uvedeným databázou na úrovni genómu vytvorenou v rámci projektu sa podporí aj nadchádzajúca zmena paradigmy systému zdravotnej starostlivosti po zriadení príslušných regulačných orgánov. Podľa toho použitie genómových údajov v každodennom hojení a plánovaní rodiny výrazne zvýši terapeutickú bezpečnosť a zníži výskyt závažných genetických ochorení. Keďže zámerom politiky v oblasti zdravia je vyvinúť a nahrať národný informačný systém v oblasti zdravia, údaje získané z tohto projektu slúžia ako dobrý pilotný projekt. Z hľadiska metodiky projektu dosahujú zamýšľané ciele najmodernejšie molekulárne biologické, bioinformatické, molekulárne genetické, biochemické, bunkové, bunkové a kmeňové metódy a modelové metódy pre zvieratá in vivo využívajúce širokú škálu metodologického spektra (napr. indukovaná technológia pluripotentných kmeňových buniek mimo „stavu“ in vitro). Integrácia výskumných pracovníkov zapojených do základného výskumu je nevyhnutná aj pre úspešnú spoluprácu medzi jednotlivými centrami (sieť starostlivosti o zriedkavé choroby), pretože ich výskumná oblasť zapadá do témy a môže prispieť k optimálnemu fungovaniu klinickej siete s ich odbornými znalosťami. B) Účasť výskumnej činnosti EXECUTIVE REPUBLIC je založená na troch kľúčových pilieroch: výskum patogenézy, diagnostiky a terapie zriedkavých chorôb. Výskumný projekt bude realizovaný na Univerzite v Szegede na Ústave lekárskej genetiky SZTE, Centre vnútornej medicíny a kardiológie č. 2 SZTE, Detskej klinike a Detskom centre SZTE a tiež v Szegede na Ústave biochémie a genetiky Maďarskej akadémie vied, Univerzite v Debrecíne, Odbornom centre pre zriedkavé choroby DE, Katedre klinickej genetiky a Univerzite Pécs na Ústave lekárskej genetiky, Ústave lekárskej biochémie a neurologickej klinike. I. VÝSKUM PATOGENÉZY ZRIEDKAVÝCH CHORÔB I/1. Úloha 1: (údaje v zátvorkách udávajú počet pacientov, ktorí majú byť zahrnutí) Znalosť pato-mechanizmu kože s transformáciou nádoru (n=50) a monogénnymi ochoreniami, ktoré vedú k náhlej srdcovej smrti (n=550). Stanovenie špecifického panelu mutácií maďarskej populácie novonarodených metabolických ochorení (n=30). Funkčné vyšetrenie mutácií zodpovedných za vývoj Alportovho syndrómu (n=50). Metódy: Funkčné skúšky v expresných systémoch a bunkových líniách in vitro, hmotnostné spektroskopické merania a sekvenovacie plošiny novej generácie. Implementačné inštitúcie: Ústav lekárskej genetiky SZTE, Ústav internej medicíny a kardiológie č. 2, SZTE ÁOK Detská klinika a Centrum zdravia detí a MTA SZBK Sequencing Platform. I/2 úloha 1: Funkčný translačný výskum v zriedkavých formách monogénneho diabetu (n=10 mutácií), monogénnych syndrómov (n=3 mutácií) a monogénnych zrážanlivých porúch (n=8 mutácií). Metódy: funkčné štúdie (stabilita, aktivita, enzymatika) na rekombinantných systémoch a kožných fibroblastoch. Implementačné inštitúcie: Ale Odborné centrum zriedkavých chorôb, Oddelenie klinickej genetiky. I/3 úloha 1: Je možné funkčne anotovať nové gény pri neurogenetických ochoreniach. Metódy: konvenčná a nová generácia sekvencovania. Implementačné inštitúcie: Ústav lekárskej genetiky Pte. II. VÝVOJ V DIAGNOSTIKE ZRIEDKAVÝCH CHORÔB II/1. Úloha 1: Nová generácia sekvencovania diagnostické pa
