Projekt správy operačného programu je navrhnutý tak, aby zabezpečil efektívnu správu štrukturálnych fondov EÚ. V rámci tohto projektu sa zabezpečuje financovanie výdavkov súvisiacich s výkonom funkcií správy štrukturálnych fondov EÚ zverených ministerstvu životného prostredia, ako je stanovené v Pravidlách správy technickej pomoci schválených vyhláškou ministra financií č. 1K-337 z 28. októbra 2014, ktorou sa schvaľujú pravidlá správy technickej pomoci.