PATOGÉNY REZISTENTNÉ VOČI ANTIBIOTIKÁM, AKO JE ENTEROCOCOCO-VANKOMYCÍN-REZISTENTNÝ (REV), SÚ RASTÚCIM PROBLÉMOM U HOSPITALIZOVANÝCH PACIENTOV A ČASTO SPÔSOBUJÚ INFEKCIE PO LIEČBE ANTIBIOTIKAMI. INFEKCIE ERV ZVYČAJNE ZAČÍNAJÚ V ČREVE. ZA NORMÁLNYCH PODMIENOK JE NAŠE ČREVO KOLONIZOVANÉ STOVKAMI KOMENZÁLNYCH BAKTÉRIÍ, MIKROFLÓROU, KTORÁ INHIBUJE ČREVNÚ KOLONIZÁCIU VRE, KTORÁ SA NAZÝVA „ODOLNOSŤ VOČI KOLONIZÁCII“ (CR). NAOPAK, PODÁVANIE ANTIBIOTÍK MENÍ ZLOŽENIE MIKROFLÓRY, KTORÉ UMOŽŇUJE VRE KOLONIZOVAŤ ČREVO A POTOM SA ROZŠÍRIŤ DO KRVI, KDE MÔŽE OHROZIŤ ŽIVOT PACIENTA. PRETO JE NEVYHNUTNÉ POCHOPIŤ, AKO A ČO ČLENOVIA MIKROFLÓRY SPÔSOBUJÚ CR A AKO ANTIBIOTIKÁ PODPORUJÚ INFEKCIU, AK CHCEME PREDCHÁDZAŤ INFEKCIÁM VRE. ABSENCIA TECHNÍK NA ANALÝZU MIKROFLÓRY VŠAK SŤAŽILA ŠTÚDIUM TEJTO KLINICKY RELEVANTNEJ OBLASTI. NAŠŤASTIE NOVÉ HROMADNÉ SEKVENCOVACIE TECHNIKY TERAZ UMOŽŇUJÚ PODROBNÉ ŠTÚDIUM MIKROFLÓRY A JEJ GÉNOV (MIKROBIOM). NAŠA SKUPINA JE PRIEKOPNÍKOM TEJTO NOVEJ METODIKY NA IDENTIFIKÁCIU ZMIEN MIKROFLÓRY, KTORÉ PODPORUJÚ KOLONIZÁCIU VRE A IDENTIFIKUJÚ TIE BAKTERIÁLNE DRUHY, KTORÉ PRENÁŠAJÚ CR. UKÁZALI SME, ŽE ODSTRÁNENIE URČITÝCH BAKTÉRIÍ Z MIKROFLÓRY, VRÁTANE BARNESIELLA, RUMINOCOCCACEAE, LACHNOSPIRACEAE, ALISTIPES, ALLOBACULUM, ZVYŠUJE RIZIKO INFEKCIE. OKREM TOHO REKONŠTITÚCIA MYŠÍ LIEČENÝCH ANTIBIOTIKAMI TÝMITO BAKTÉRIAMI VÝRAZNE ZNIŽUJE KOLONIZÁCIU VRE. PO IDENTIFIKOVANÍ ŠPECIFICKÝCH BAKTÉRIÍ MIKROBIOTY, KTORÉ PODPORUJÚ CR, V TOMTO PROJEKTE NAVRHUJEME IDENTIFIKOVAŤ MECHANIZMY, KTORÝMI TIETO BAKTÉRIE POSKYTUJÚ OCHRANU. Z NAŠICH ZVEREJNENÝCH VÝSLEDKOV VYPLÝVA, ŽE MIKROBIOTA POSKYTUJE CR V NEPRÍTOMNOSTI ZÁKLADNÝCH ZLOŽIEK IMUNITNÉHO SYSTÉMU. PRETO SA V TOMTO PROJEKTE ZAMERIAME NA IDENTIFIKÁCIU MECHANIZMOV, KTORÝMI MIKROBIOTA PRIAMO SPÔSOBUJE REZISTENCIU (KOMETIKA ŽIVINAMI, VÝROBA INHIBIČNÝCH LÁTOK). NA DOSIAHNUTIE TOHTO CIEĽA NAJPRV DEFINUJEME ŽIVINY POUŽÍVANÉ PATOGÉNNYMI A OCHRANNÝMI BAKTÉRIAMI (BPS) V ČREVE MYŠÍ. NA TENTO ÚČEL POUŽIJEME OMICKÉ TECHNIKY (METAGENOMICA A METATRANSCRIPTOMICA) NA IDENTIFIKÁCIU GÉNOV EXPRIMOVANÝCH NA ZÍSKANIE ŽIVÍN IN VIVO A METABOLOMICKÉ TECHNIKY NA IDENTIFIKÁCIU ŽIVÍN, KTORÉ SA PO KOLONIZÁCII VRE ALEBO BPS ZNÍŽILI IN VIVO. OKREM TOHO BUDEME IDENTIFIKOVAŤ IN VITRO „POLE“ ŽIVINY, KTORÉ SÚ NEVYHNUTNÉ PRE RAST VRE, A POMOCOU TECHNIKY IDENTIFIKÁCIE MUTANTOV TRANSPOZÍCIOU IN VIVO, BUDEME IDENTIFIKOVAŤ GÉNY, KTORÉ VRE POTREBUJE KOLONIZOVAŤ ČREVO A ZÍSKAŤ ŽIVINY. PO DEFINOVANÍ STRATÉGIÍ, KTORÉ POUŽÍVAJÚ VRE A BPS NA VYUŽÍVANIE ŽIVÍN, TESTY KOMPETENCIE IN VITRO A IN VIVO UKÁŽU ÚLOHU SÚŤAŽE O ŽIVINY V CR VERZUS VRE. NA DRUHEJ STRANE IN VIVO OMICKÉ PROFILY BPS IDENTIFIKUJÚ MOŽNÉ INHIBIČNÉ MOLEKULY, KTORÉ BUDÚ TESTOVANÉ V TESTOCH INHIBÍCIE RASTU S CIEĽOM DEFINOVAŤ ÚLOHU TÝCHTO MOLEKÚL V CR. INFORMÁCIE ZÍSKANÉ V RÁMCI TOHTO PROJEKTU POVEDÚ K NOVÝM TERAPEUTICKÝM STRATÉGIÁM NA BOJ PROTI INFEKCIÁM ERV, PATOGÉNU, KTORÝ ZÍSKAVA ODOLNOSŤ VOČI NIEKOĽKÝM DOSTUPNÝM TERAPEUTICKÝM MOŽNOSTIAM.
