Pomimo rosnącej na świecie świadomości o powiązaniu składu mikrobiomu jelit z różnego typu chorobami, w Polsce nie istnieje zbiór informacji o referencyjnych mikrobiomach. Powstanie tego typu zbioru umożliwi prowadzenie w Polsce badań w zakresie powiązania komponentów flory bakteryjnej jelit ze stylem życia, poszczególnymi chorobami czy odpowiedzią pacjenta na stosowaną terapię. Biorąc za przykład takie kraje jak Stany Zjednoczone, proponujemy stworzenie unikatowego przetworzonego zbioru informacji naukowych, opisującego zmienność mikrobiomów mieszkańców Polski (Mapa Mikrobiomu Polski) poprzez dostarczenie solidnych danych, opisujących zmienność mikrobiomów jelit w obrębie populacji Polski. Ponadto dzięki zdefiniowaniu Protokołu Pozyskiwania Danych, badania prowadzone przez użytkowników MMP będą porównywalne z informacjami zgromadzonymi w MMP. Rezultatem projektu będzie narzędzie dla wszystkich pól nauk przyrodniczych, zwłaszcza takich dyscyplin jak genetyka, medycyna, farmakologia, biochemia i bioinformatyka.