Celem projektu jest badanie patogenezy chorób rzadkich za pomocą nowych metod diagnostycznych, które same w sobie stanowią zmianę paradygmatu i wartość dodaną, ponieważ postęp technologiczny zasadniczo zmienił efektywność diagnostyczną w tej dziedzinie. Zgodnie z celami Międzynarodowego Konsorcjum Chorób Rzadkich i poprzez organizację współpracy doskonałości, celem projektu jest kontynuacja terapii. Jedną z głównych nowości tego programu badawczego jest to, że poprzez synergistyczną koordynację węgierskich najnowocześniejszych zdolności badawczych stwarza klientowi możliwości dalszego uczestnictwa w współpracy krajowej i międzynarodowej, publikowania w wiodących czasopismach (jakość Q1, D1) w tej dziedzinie i tworzenia szeregu nowych prac badawczo-rozwojowych. Wyniki będą stanowić wyjątkową na arenie międzynarodowej okazję do zrozumienia patogenezy rzadkich chorób, opracowania nowych procedur diagnostycznych i terapeutycznych, włączenia ich do kliniki w dłuższej perspektywie, a tym samym zapewnienia długoterminowej trwałości wyników. Powstaje węgierska baza danych exom, która jest niezbędna do projektowania zindywidualizowanej diagnostyki i leczenia, a także do projektowania nowoczesnych badań podstawowych i farmaceutycznych opartych na podstawach genetycznych. Zgodnie z powyższym utworzona w ramach projektu baza danych na poziomie genomu będzie również wspierać zbliżającą się zmianę paradygmatu systemu opieki zdrowotnej po ustanowieniu odpowiednich organów regulacyjnych. Zgodnie z tym, wykorzystanie danych genomowych w codziennym gojeniu i planowaniu rodziny znacznie zwiększy bezpieczeństwo terapeutyczne i zmniejszy częstość występowania poważnych chorób genetycznych. Ponieważ celem polityki zdrowotnej jest opracowanie i załadowanie krajowego systemu informacji o zdrowiu, dane uzyskane w ramach tego projektu służą jako dobry pilotaż. Jeśli chodzi o metodologię projektu, najnowocześniejsze metody biologiczne molekularne, bioinformatyczne, genetyczne molekularne, biochemiczne, komórkowe i macierzyste oraz metody modeli zwierzęcych in vivo, wykorzystujące szeroki zakres spektrum metodologicznego (np. indukowana technologia pluripotencjalnych komórek macierzystych, poza „stanem sztuki” in vitro) osiągają zamierzone cele. Integracja naukowców zaangażowanych w badania podstawowe ma również zasadnicze znaczenie dla udanej współpracy między poszczególnymi ośrodkami (sieć opieki nad rzadkimi chorobami), ponieważ ich obszar badawczy wpisuje się w dany temat i może przyczynić się do optymalnego funkcjonowania sieci klinicznej dzięki ich wiedzy fachowej. B) Udział działalności badawczej REPUBLIKI EXECUTIVE opiera się na trzech kluczowych filarach: badania nad patogenezą, diagnostyką i terapią chorób rzadkich. Projekt badawczy będzie realizowany na Uniwersytecie w Szeged w Instytucie Genetyki Medycznej SZTE, Centrum Medycyny Wewnętrznej i Kardiologii Nr 2 SZTE, Klinice Dziecięcej i Centrum Dziecięcego SZTE, a także w Szeged w Instytucie Biochemii i Genetyki Węgierskiej Akademii Nauk, na Uniwersytecie w Debreczynie, Centrum Ekspertów Chorób Rzadkich, Klinice Genetyki Klinicznej oraz Uniwersytecie Peczu w Instytucie Genetyki Medycznej, Instytucie Biochemii Medycznej i Klinice Neurologicznej. I. BADANIA NAD PATOGENEZĄ CHORÓB RZADKICH I/1. Zadanie 1: (dane w nawiasach wskazują liczbę pacjentów, które należy uwzględnić) Wiedza o patomechanizmie skóry z transformacją nowotworową (n=50) i chorobami monogennymi prowadzącymi do nagłej śmierci serca (n=550). Określenie specyficznego panelu mutacyjnego węgierskiej populacji noworodków filtrowanych chorobami metabolicznymi (n=30). Badanie funkcjonalne mutacji odpowiedzialnych za rozwój zespołu Alporta (n=50). Metody: Testy funkcjonalne w systemach ekspresji i liniach komórkowych in vitro, pomiarach spektroskopowych mas i platformach sekwencjonowania następnej generacji. Instytucje wdrażające: Instytut Genetyki Medycznej SZTE, Instytut Medycyny Wewnętrznej i Kardiologii Nr 2, Klinika Dziecięca i Centrum Zdrowia Dziecka SZTE ÁOK oraz Platforma Sekwencjonowania MTA SZBK. I/2 Zadanie 1: Funkcjonalne badania translacyjne w rzadkich postaciach monogenicznej cukrzycy (n=10 mutacji), zespołach monogennych (n=3 mutacje) i monogennych zaburzeniach krzepnięcia (n=8 mutacji). Metody: badania funkcjonalne (stabilność, aktywność, enzymatyka) w układach rekombinowanych i fibroblastach skóry. Instytucje wdrażające: Ale Centrum Ekspertów Chorób Rzadkich, Katedra Genetyki Klinicznej. I/3 Zadanie 1: Można funkcjonalnie adnotować nowe geny w chorobach neurogenetycznych. Metody: sekwencjonowanie konwencjonalne i nowej generacji. Instytucje wdrażające: Instytut Genetyki Medycznej Pte. II. ZMIANY W DIAGNOSTYCE CHORÓB RZADKICH II/1. Zadanie 1: Nowa generacja sekwencjonowania pa
