L-għan ewlieni huwa li tiġi żgurata l-implimentazzjoni bla xkiel u effiċjenti tal-programmi operattivi: POIG, POKL u POPC. Il-POPT jipprovdi riżorsi finanzjarji għat-trattament ta’ proċessi fil-qasam tat-tħejjija, il-ġestjoni, l-implimentazzjoni, il-monitoraġġ, l-evalwazzjoni u l-kontroll tal-implimentazzjoni, kif ukoll l-informazzjoni u l-promozzjoni tal-programmi tal-Unjoni.