A) Preżentazzjoni tal-kompiti li għandhom jiġu implimentati: L-għan tal-proġett huwa li jakkwista u jopera sett ta’ strumenti li huma adattati għall-identifikazzjoni/karatterizzazzjoni ta’ komposti organiċi u komposti organiċi naturali (tal-pjanti, fungali u batteriċi) ġodda prodotti permezz ta’ sinteżi kimika, il-konjugati tagħhom (derivattivi diretti, nanopartikoli kollojdali) u l-metaboliti tagħhom, kif ukoll għar-riċerka ta’ bidliet fil-livell tal-proteini (proteomiċi) fiċ-ċelloli minħabba l-influwenza tal-komposti. Fit-trattament kemm ta’ mard tat-tumur kif ukoll ta’ mard li jerġa’ jinfetta mill-ġdid ta’ oriġini mikrobjali, jista’ jsir progress kbir permezz tal-hekk imsejħa terapija diretta, li żżid is-selettività tas-sustanzi attivi u tnaqqas l-effetti sekondarji tagħhom. Il-karatteristika komuni ta’ din id-direzzjoni ġdida tar-riċerka farmaċewtika hija l-ħolqien ta’ komposti li jistgħu jimmiraw is-sustanza attiva lejn it-tumur affettwat jew iċ-ċellola infettata. L-infrastruttura li għandha tiġi żviluppata timmira għall-iżolament, l-identifikazzjoni u l-karatterizzazzjoni ta’ komposti attivi bijoloġikament ġodda prodotti b’mod naturali (konjugati b’peptidi u/jew nanosistemi) prodotti minn sinteżi kimika organika, f’konformità mal-ogħla standards internazzjonali. Il-maġġoranza l-kbira tas-sustanzi bijoloġikament attivi attwalment użati fil-mediċina huma metaboliti sekondarji tal-pjanti, fungi u mikroorganiżmi procaryote jew huma komposti sintetiċi semisintetiċi relatati. Wieħed mill-għanijiet ewlenin tar-riċerka tagħna huwa li jiġu identifikati u kkaratterizzati sustanzi attivi ġodda u l-metaboliti ta ‘l-oriġini tal-pjanti, fungali jew mikro-organiżmu. B’dan l-iżvilupp infrastrutturali, għandna l-għan li nwessgħu l-possibbiltà li niskopru sustanzi attivi mediċinali u tossiċi addizzjonali tal-pjanti u l-profil tal-karatterizzazzjoni tal-komposti. Matul ir-riċerka, aħna niddefinixxu mhux biss sustanza attiva ta’ organiżmu, iżda wkoll “metabolita tal-marki tas-swaba’” dejjem aktar fundamentali fil-prattika internazzjonali. Huwa importanti li wieħed jinnota li, skont xi ipoteżijiet, il-biċċa l-kbira tas-sustanzi attivi li ma kinux magħrufa qabel jistgħu jiġu identifikati b’mod effettiv u kkaratterizzati minn din l-istrateġija. Għal raġunijiet simili, il-karatterizzazzjoni metabolika ta’ prodotti metaboliċi ta’ mikrobi li jgħixu f’kundizzjonijiet estremi hija promettenti (professjonali responsabbli: Istitut tal-Bijoloġija, Dipartiment tal-Pjanti Organoloġija, Dipartiment tal-Mikrobijoloġija). Il-maġġoranza tal-bijokonjugati adattati għal terapija mmirata jikkonsistu fi tliet komponenti; is-sustanza attiva, il-molekula ta’ kontroll u l-unità ta’ interkonnessjoni. Fir-riċerka tagħna nippruvaw noħolqu ħwienet komposti li fihom is-sustanza attiva (naturali jew sintetizzati) u l-kontroll tal-komponenti tal-peptide jistgħu jintrabtu flimkien f’firxa wiesgħa ta ‘kombinazzjonijiet mal-linkers bifunzjonali żviluppati, iżidu l-firxa ta’ konjugati adattati għal terapija mmirata, li tista ‘wkoll tkun prerekwiżit għall-fejqan personalizzat. Minbarra l-identifikazzjoni u l-karatterizzazzjoni tal-komponenti prodotti u l-konjugati prodotti minnhom, l-istabbiltà, il-metaboliżmu u l-bidliet fil-livell tal-proteini indotti miċ-ċelloli fis-sistemi bijoloġiċi huma essenzjali wkoll għall-kejl tal-pjattaforma analitika tagħhom permeabbli ħafna u ta’ tfixkil kbir (operatur professjonali: Istitut tal-kimika, MTA-ELTE Peptidchemical Research Group). Iż-żewġ oqsma ta’ riċerka ta’ hawn fuq jiddependu b’mod konġunt fuq l-apparat “cut edge” li għadu kemm ġie akkwistat UHPLC-MS/MS, li mhux biss huwa adattat għal analiżi sempliċi ta’ rutina, iżda għandu wkoll potenzjal sinifikanti ta’ riċerka. Analiżi kwalitattiva u kwantitattiva tal-komponenti tal-kampjuni tista’ titwettaq bl-użu ta’ sistema (HPLC-MS/MS) assoċjata ma’ kromatografija likwida (HPLC) iddisinjata għall-ksib, li tippermetti determinazzjoni tal-massa ta’ preċiżjoni għolja, bi quadrupol u detezzjoni tal-massa ta’ orbitrap. Il-kwantità tal-komponenti li għandhom jiġu ttestjati tista’ tvarja skont l-ordni tal-kobor. Is-sistema hija adattata għat-twettiq ta’ testijiet tal-kromatografija likwida ultra-effiċjenti (UHPLC), li jqassru b’mod sinifikanti l-ħin tal-kejl, u b’hekk jiżdied in-numru ta’ kampjuni li jistgħu jiġu pproċessati u jitnaqqas l-użu tas-solventi. L-identifikazzjoni u l-kwantifikazzjoni ta’ sustanzi separati hija pprovduta permezz ta’ ditekter diode array (190–800 nm), detezzjoni ta’ spettrometrija tal-massa b’riżoluzzjoni għolja permezz tal-ispettrometru tal-massa ta’ quadrupol-orbitrap ibridu. L-operazzjoni fuq firxa wiesgħa ta’ massa (m/z 50–2000) bi spettrometri tal-massa ta’ preċiżjoni għolja (inqas minn 5 ppm) tippermetti wkoll l-identifikazzjoni strutturali u l-identifikazzjoni tal-profil tat-tniġġis billi tipprovdi sensittività unika (attogramma). Ir-reġistrazzjoni tal-SM/MS hija pprovduta minn ċellula ta’ impatt HCD ta’ enerġija għolja, li tippermetti reġ...