L-iżvilupp tal-infrastruttura kristallografika ELTE tar-raġġi X biex tinvestiga u tirfina l-istruttura u l-interazzjonijiet ta’ bijokromatolekoli u molekuli bijoloġikament attivi

A) L-GĦAN Nru 2 — L-għan tal-proġett huwa li jippromwovi l-kimika strutturali domestika u r-riċerka bijoloġika strutturali, li jappoġġja t-tnedija ta’ attivitajiet ġodda ta’ riċerka bażika u innovazzjoni billi jespandi l-infrastruttura eżistenti tad-diffrazzjoni bir-raġġi X. L-infrastruttura attwali tikkonsisti f’laboratorji mgħammra ta’ kristallizzazzjoni, robot kristallizzanti u diffrattometru antikwattiku adattat għall-ittestjar tal-istruttura tal-proteini. L-iżvilupp ippjanat, l-akkwist ta’ diffractometer b’annodu rotatorju u ditekter tal-pixel ibridu l-aktar avvanzat, jagħmilha possibbli li tiġi estiża l-firxa ta’ applikazzjonijiet bl-għajnuna ta’ apparat ġdid b’sensittività unika fl-Ungerija. L-importanza tar-riċerki dwar id-diffrazzjoni tar-raġġi X — In-netwerk ta’ interazzjoni regolat tajjeb tal-molekuli għandu rwol inevitabbli fil-funzjonament tal-organiżmu ħaj, inklużi l-interazzjonijiet u l-kumplessi permanenti jew tranżitorji ta’ proteini ma’ xulxin u ma’ molekuli oħra. Ir-rappreżentazzjoni tridimensjonali għandha rwol ewlieni fil-fehim ta’ dawn il-proċessi. Diffrazzjoni tar-raġġi X — fejn is-suċċess tal-kejl, il-kontenut ta ‘informazzjoni tad-data mkejla jiddependi kemm fuq il-kwalità tal-kristall ittestjat kif ukoll fuq l-istat tal-arti tal-apparat tad-diffrazzjoni, hija waħda mill-għodod ewlenin għall-eżami spazjali ta’ molekuli, kumplessi molekulari u interazzjonijiet fid-dettall atomiku. Il-Punti Fokali ta’ RESEARCH — Il-proġett jiġbor flimkien riċerka interdixxiplinari, li tiffoka fuq interazzjonijiet intermolekulari, karatterizzazzjoni atomika u disinn ta’ xejriet ta’ interazzjoni spazjali fil-kumplessi ta’ proteini u kristalli żgħar ta’ molekula. Wieħed mill-għanijiet ewlenin tar-riċerka tagħna huwa li nifhmu aħjar il-funzjoni tal-proteini u n-netwerks tal-proteini li jistgħu jiġu mislufa, li nimmappjaw il-proprjetajiet mibdula tal-interazzjoni strutturali tal-varjanti tal-proteini u l-bidliet fil-proteini assoċjati mal-mard, biex jgħinu fit-tfassil tal-ligandi u l-proteini (motifi tal-peptide li jistgħu jintużaw). 1) Modifika kimika tal-proteina relatata mal-mard (eż. l-ossidazzjoni hija l-proteina DJ-1 li twettaq il-funzjoni protettiva kontra l-marda ta’ Parkinson; mutazzjonijiet ta’ punt fil-każ ta’ enzima responsabbli għall-produzzjoni ta’ pseudouridine involuta fl-irfinar tal-istruttura RNA) u l-fehim taċ-ċaqliq strutturali u ta’ interazzjoni li jirriżulta minn dawn, sabiex jiġu ċċarati l-elementi strutturali tal-funzjoni. Barra minn hekk, l-għan tagħna huwa li nipprovdu assistenza effettiva fit-tfassil ta’ ligandi speċifiċi (flimkien ma’ metodi permeabbli ħafna) u fl-użu ta’ ligandi avvanzati bħala sustanzi kandidati jew sensuri molekulari (eż. DJ-1 u D-aminoacid oxidase). Id-difraktometru li għandu jinkiseb regolarment jiġbor ukoll data ta’ kejl ta’ kwalità għolja minn kristalli li jferrxu inqas, li jħaffef il-proċess tad-disinn. 2) Permezz ta’ inibizzjoni speċifika tal-attivazzjoni anormali tas-sistema immunitarja, jistgħu jiġu żviluppati molekuli tal-inibituri li jistgħu jintużaw fil-mediċina jew f’eżami aktar dettaljat tar-rotot ta’ attivazzjoni (eż. sistema komplementari). Bl-infrastruttura tad-diffrazzjoni tar-raġġi X, irridu nifhmu l-ispeċifiċità u s-selettività ta ‘dawn il-molekuli ġodda tal-inibitur tal-proteina żviluppati b’evoluzzjoni direzzjonali. 3) Bejn il-mudelli ta’ interazzjoni bejn il-proteini u l-proteini, l-interazzjonijiet tal-proteini tal-glandoli huma wkoll sinifikanti mil-lat mediku, li huma kkaratterizzati mir-rikonoxximent ta’ diversi motivi li jistgħu jiġu mislufa, u b’hekk jaffettwaw b’mod sinifikanti l-proċessi fiżjoloġiċi billi jinfluwenzaw l-operazzjoni ta’ diversi msieħba tal-proteini (eż. proteini S100 involuti fil-metastasi, jew kinasi MAP, tyrosine kinases li jikkontrollaw id-diviżjoni taċ-ċelloli u l-proċessi tal-moviment involuti fil-proċessi tat-trażmissjoni tas-sinjali). Il-bidla kimika tas-superfiċji li jistgħu jiġu mislufa bil-proteini (eż. il-fosforilazzjoni) hija universali fir-regolamentazzjoni tal-proċessi tat-trażmissjoni tas-sinjali, ħafna drabi fl-isfond ta’ proċessi patoloġiċi. 4) Fil-każ ta ‘awto-organizzati, multimers-ġenerazzjoni proteini li jisseparaw ir-reazzjoni kimika li jikkatalizza mid-dinja ta’ barra minn sistema kavità, b’hekk miri potenzjali għall-applikazzjonijiet bijoteknoloġiċi, l-għan tagħna huwa li jidentifikaw u jikkaratterizzaw dettalji strutturali importanti għall-awto-organizzazzjoni tal-proteina (oligopeptidases). 5) Billi niddefinixxu l-istruttura ta’ molekuli żgħar, wieħed mill-għanijiet tagħna huwa d-determinazzjoni ta’ preċiżjoni għolja tal-molekuli, li minnhom nistgħu nidduċu l-bidla tar-reattività fi ħdan serje ta’ komposti fil-każ ta’ komposti bijoloġikament attivi (eż. derivattivi tal-ferroċen, komposti b’azzjoni ċitostatika). 6) Selettiv, ir-rikonoxximent Kiral tal-imsieħba li jistgħu jiġu mislufa huwa essenzjali fil-funzjonament tas-sistemi bijoloġiċi. Fil-produzzjoni ta ‘molekuli bijoattivi, għalhe...