It-tim ospitanti tagħna EA2656, GRAM 2.0 (Grupp ta ‘Riċerka Adattament Militari) huwa tim uniku, bi-sit fil cotutal bejn l-universitajiet ta’ Caen u Rouen. Hija parti minn Federation Hospitalo-Universitaire (FeNOMIH) li tiġbor flimkien is-servizzi tal-batterjoloġija, il-viroloġija, il-parasitoloġija/il-mikoloġija, l-iġjene tal-isptar u l-infetjoloġija taċ-CHUs ta’ Caen u Rouen. It-tim ta’ GRAM 2.0 għandu 2 Ċentri Nazzjonali ta’ Referenza għall-Mard Trasmissibbli (il-kejl/il-massimi/ir-rubella, l-HIV). Għalhekk għandha ħafna assi biex tilħaq b’mod effettiv l-għanijiet tal-proġett DynaMic-H. Ma’ dawn l-assi tiżdied l-integrazzjoni f’dan il-proġett tad-Dipartimenti tal-Mediċina Ġenerali tal-UFR Santé ta’ Caen u Rouen, involuti fit-teħid ta’ kampjuni u l-ġbir tad-data fil-kura primarja. Huwa netwerk ta’ professjonisti tas-saħħa f’kuntatt mal-popolazzjoni ġenerali, ta’ valur kbir biex jiddeskrivi l-kuntest tal-akkwist tal-patoġenu fil-kura primarja. Il-proġett DynaMic-H jibni fuq approċċ integrattiv għall-patoloġija infettiva b’kont meħud tal-influwenza tad-dinamika tal-bidliet fil-bilanċ tal-mikrobijomi. Dawn il-komunitajiet ta ‘speċi mikrobjali jikkolonizzaw organiżmu tagħna matul il-ħajja. Huma jinteraġixxu b’mod sinifikanti ma ‘l-attivitajiet fiżjoloġiċi tagħna, b’mod partikolari mal-sistemi immuni, metaboliċi u newro-konjittivi. Dan il-proġett ta ‘riċerka jiffoka fuq il-mikrobijoma umana (jew microbiota), li huwa definit bħala l-batterji kollha, viruses, fungi u mikroorganiżmi oħra preżenti fil-kompartimenti varji jew niċeċ ekoloġiċi ta ‘organiżmu tagħna. Il-proġett DynaMic-H għandu l-għan li jistudja l-mikrobijomassa u l-interazzjonijiet tagħhom ma’ infezzjonijiet virali u batteriċi. Minħabba l-oqsma ta’ kompetenza tal-membri tal-GRAM 2.0, il-komponent ewlieni huwa l-mikrobijoma respiratorja orofarinġeali u jinkludi wkoll żewġ studji pilota, li jinvolvu l-kompartiment enteriku u l-kompartiment urinarju/vaġinali. Il-kampjuni se jintgħażlu u jitħejjew għal sekwenzar metaskritmiku b’debitu għoli mingħajr ma jiġu ottimizzati a priori u ottimizzati mħallta (sekwenzi twal u teknoloġija qasira ta’ Nanopor u Illumina rispettivament) li tippermetti analiżi bijoinformatika tal-abbundanza u l-espressjoni funzjonali tal-ġeni mikrobjali. Analiżi multivarjata ta’ dejta ta’ fluss għoli se tidentifika profili assoċjati mal-varjabbli ttestjati. Dawn se jkunu bbażati fuq sistemi ta’ pajpijiet bijoinformatika żviluppati u diġà disponibbli, kapaċitajiet adattati ta’ informatika u ħżin disponibbli lokalment, u traskritomiċi u (meta)ġenomiċi ta’ proġetti pilota u kollaboraturi diġà disponibbli.
