Financijski instrument Fonda za upravljanje vodama bit će usmjeren na povećanje dostupnosti i kvalitete opskrbe pitkom vodom i gospodarenje otpadnim vodama kako bi se okoliš zaštitio od štetnih učinaka otpadnih voda, povećao broj korisnika priključenih na centralizirane sustave i ukupan broj korisnika centraliziranih sustava, poboljšala kvaliteta i učinkovitost usluga te smanjili gubici i nesreće u mrežama. Prema analizi preliminarne procjene ukupni manjak financijskih sredstava u sektoru upravljanja vodama iznosi oko 3,5 milijardi EUR. Republika Litva ima više od 14 000 kilometara opskrbe pitkom vodom i više od 10 000 kilometara mreža za prikupljanje otpadnih voda, od kojih se više od polovine pogoršalo 60 % ili više, a stopa gubitka vode i infiltracije vrlo je loša. Priključak stanovništva na opskrbu pitkom vodom i mreže za prikupljanje otpadnih voda znatno se razlikuje među općinama – procjenjuje se da, kako bi se dostigao 95 % priključenih potrošača, oko 13 % potrošača mora biti priključeno na mreže za pitku vodu, a 16 % potrošača mora biti priključeno na kanalizacijsku mrežu. Fond će licenciranim javnim opskrbljivačima i upraviteljima otpadnih voda osigurati dugoročne zajmove (do 20 godina) za razvoj i obnovu mreža za opskrbu pitkom vodom i prikupljanje otpadnih voda.