Naš hosting tim EA2656, GRAM 2.0 (Istraživačka grupa za vojnu prilagodbu) jedinstven je tim, bi-site u cotutalu između sveučilišta Caen i Rouen. Dio je federacije Hospitalo-Universitaire (FeNOMIH) koja okuplja usluge bakteriologije, virologije, parazitologije/mikologije, bolničke higijene i infektiologije CHU-a Caen i Rouen. Tim GRAM 2.0 ima 2 nacionalna referentna centra prenosive bolesti (ospice/mumps/rubella, HIV). Stoga ima mnogo sredstava za učinkovito ispunjavanje ciljeva projekta DynaMic-H. Dodati tim sredstvima integraciju u ovaj projekt Odjela opće medicine UFR Santé of Caen i Rouen, koji su uključeni u uzorkovanje i prikupljanje podataka u primarnoj skrbi. To je mreža zdravstvenih djelatnika u kontaktu s općom populacijom, vrlo vrijedno opisati kontekst akvizicije patogena u primarnoj skrbi. Projekt DynaMic-H temelji se na integrativnom pristupu zaraznoj patologiji uzimajući u obzir utjecaj dinamike promjena u ravnoteži mikrobioma. Ove zajednice mikrobnih vrsta koloniziraju naš organizam tijekom cijelog života. Oni značajno komuniciraju s našim fiziološkim aktivnostima, osobito s imunološkim, metaboličkim i neurokognitivnim sustavima.Ovaj istraživački projekt fokusira se na ljudski mikrobiom (ili mikrobiota), koji se definira kao sve bakterije, virusi, gljivice i drugi mikroorganizmi prisutni u različitim odjeljcima ili ekološkim nišama našeg organizma. Cilj projekta DynaMic-H je proučavanje mikrobioma i njihovih interakcija s virusnim i bakterijskim infekcijama. Zbog područja stručnosti članova GRAM 2.0, glavna komponenta je orofaringealni respiratorni mikrobiom, a uključuje i dvije pilot studije, koje uključuju enterički odjeljak i urinarni/vaginalni odjeljak. Uzorci će biti odabrani i pripremljeni za visokodebitno meta-trankriptomsko sekvenciranje bez a priori optimizirane mješovite optimizirane (duge sekvence i kratke Nanopore i Iluminatske tehnologije) što omogućuje bioinformatiku analize brojnosti i funkcionalne ekspresije mikrobnih gena. Višestrukim analizama podataka visokog protoka utvrdit će se profili povezani s ispitanim varijablama. Temeljit će se na bioinformatičkim cjevovodima koji su razvijeni i već dostupni, prilagođeni kapacitetima za računalstvo i pohranu koji su dostupni na lokalnoj razini te već dostupni transkriptomika i (meta)genomika pilot-projekata i suradnika.
