BAKTERIJSKE BOLESTI BILJAKA UZROKUJU ZNATNE GOSPODARSKE GUBITKE; NJIHOVA JE KONTROLA TEŠKA I OČEKUJE SE DA ĆE U BUDUĆNOSTI BITI TEŽA ZBOG OGRANIČENJA EU-A U POGLEDU ODOBRAVANJA AKTIVNIH TVARI DOSTUPNIH ZA INTEGRIRANU KONTROLU. PSEUDOMONAS SAVASTANOI PV. SAVASTANOI (PSV) PROIZVODI TUMORE ZRAKA U DOMAĆINU, UZROKUJUĆI JEDNU OD NAJVAŽNIJIH BOLESTI MASLINA, IAKO JE TAKOĐER PATOGENA U VELIKOM BROJU BILJNIH VRSTA. OSIM TOGA, PSV JE NEDAVNO OTKRIVEN KAO NOVI PATOGEN U UKRASNOJ VRSTI MANDEVILLA SANDERI (DIPLADENIA). P. SAVASTANOI PV. PHASEOLICOLA (PPH) JE PATOGEN OD GOSPODARSKE VAŽNOSTI U JUDIJI I JEDAN OD NAJRELEVANTNIJIH ISTRAŽIVAČKIH MODELA U PODRUČJU FITOBAKTERIOLOGIJE. JEDNA OD NAJPOŽELJNIJIH STRATEGIJA KONTROLE PPH-A JE UPORABA OTPORNIH ŽIDOVSKIH SORTI. PPH IZOLATI SU RAZVRSTANI U 9 PASMINA PREMA NJIHOVIM INTERAKCIJAMA S 8 RAZLIČITIH ŽIDOVSKIH SORTI, ŠTO JE OBJAŠNJENO MEĐUDJELOVANJEM 5 PAROVA U ODNOSU GENA I GENA, IAKO JE MOGUĆE NAPRAVITI VEĆU DIFERENCIJACIJU U DO 14 PASMINA. OBA PATOSUSTAVA NUDE NEVIĐENU PRILIKU ZA PROUČAVANJE MOLEKULARNIH BAZA SPECIFIČNOSTI GOSTA. S JEDNE STRANE, IAKO JE PPH GENETSKI HOMOGENI PATOVAR, RAZLIČITI IZOLATI POKAZUJU RAZLIKE U SVOJOJ VIRULENCIJI, ŠTO ODRAŽAVA NJIHOVU RASNU SPECIFIČNOST. S DRUGE STRANE, RAZLIČITI PATOVARES P. SAVASTANOI IZAZIVAJU SLIČNE SIMPTOME (TUMORE) U DRVENASTIH I ZELJASTIH DOMAĆINA. DOSTUPNOST ZATVORENIH GENOMA SOJEVA PPH 1448A I PSV NCPPB 3335, KAO I GENETSKI I FUNKCIONALNI ALATI RAZVIJENI TIJEKOM IZVOĐENJA NAŠIH PRETHODNIH PROJEKATA, ČINE OVE BAKTERIJE IDEALNIM MODELIMA ZA ANALIZU SPECIFIČNOSTI GOSTA I EVOLUCIJU VIRULENCIJE. DAKLE, KOMPARATIVNA I FUNKCIONALNA GENOMSKA ANALIZA FILOGENETSKI POVEZANIH BAKTERIJSKIH SOJEVA OLAKŠAT ĆE IDENTIFIKACIJU UZROČNIKA PATOGENOSTI NA RAZINI PATOVAR-A I PASMINE. GLAVNI SU CILJEVI OVOG PROJEKTA SLJEDEĆI: 1) FUNKCIONALNO IDENTIFICIRATI I KARAKTERIZIRATI RAZLIKE U SKUPU VIRULENCIJSKIH GENA PSV PATOVARA I PPH PASMINA POVEZANIH SA SPECIFIČNOŠĆU DOMAĆINA; I 2) PRIMIJENITI INFORMACIJE DOBIVENE USPOREDNIM I FUNKCIONALNIM GENOMSKIM ZA RAZVOJ DIJAGNOSTIČKIH ALATA ZA PPH PASMINE I NOVONASTALE IZOLIRANE PSV U MANDEVILLI. POSEBNI SU CILJEVI SLJEDEĆI: 1) DODIJELITI PATOVAR SOJEVIMA P. SAVASTANOI IZOLIRANIMA IZ M. SANDERI. 2) SLIJED I SNIMANJE GENOMA REPREZENTATIVNIH SOJEVA PATOVARS-A I PASMINA P. SAVASTANOI. 3) PROVESTI KOMPARATIVNU GENOMSKU ANALIZU I FILOGENETSKU ANALIZU PSV PATOVARA I PPH PASMINA. 4) PROUČAVATI BIOLOGIJU I ULOGU U SPECIFIČNOSTI DOMAĆINA PLASMAIDS-A OVIH BAKTERIJSKIH SOJEVA. 5) PRODUBITI ULOGU U GOST SPECIFIČNOSTI SUSTAVA IZLUČIVANJA, EFEKTORA SUSTAVA IZLUČIVANJA TIPA III I, 6) DRUGIH VIRULENCE FAKTORA. 7) PROUČAVATI ULOGU GENSKOG IZRAŽAVANJA U SPECIFIČNOSTI GOSTIJU. 8) RAZVITI SPECIFIČNE DIJAGNOSTIČKE ALATE ZA MANDEVILLA IZOLATE I PPH PASMINE.
