Jedan od razloga lošeg stanja estonskih rijeka jesu migracijske prepreke u rijekama. Kako bi se postiglo dobro stanje rijeka, stvoreni su migratorni uvjeti za vrlo migratorne ribe u rijekama važnima za očuvanje prirode kako bi mogle doći do mrijesta i staništa. Konkretno, vlasnici brana u rijekama lososa te osobe i poduzeća koji se bave rekreacijskim ribolovom ili su s njim povezani imaju izravne koristi od uspostave propusnica za ribe.