Pagrindinis tikslas – užtikrinti sklandų ir veiksmingą veiksmų programų įgyvendinimą: POIG, POKL ir POPC. POPT teikia finansinius išteklius Sąjungos programų rengimo, valdymo, įgyvendinimo, stebėsenos, vertinimo ir kontrolės procesams tvarkyti, taip pat informavimui apie jas ir jų skatinimui.