Atlyginimų nustatymo procesas grindžiamas partneryste su 3 dalyviais. Ji apibrėžiama taip: (1) Regiono susirinkimas Projektą dėl stažuotojų atlyginimo tvirtina regiono kompetentingos institucijos kartu su mokymo organizacijos pateiktu mokymo projekto patvirtinimu. Be to, mokymo operatoriui ir Paslaugų ir mokėjimo agentūrai (PSA) siunčiama atlyginimų patvirtinimo lentelė. 2) mokymo organizacija E2C sudaro stažuotojų atlyginimo ir socialinio draudimo bylas (tapatybės dokumentą, statuso įrodymą, RIB...) ir siunčia jas ASP. Kiekvieno stažuotojo dalyvavimas mokymuose atitinka maržą. Kiekvieno mėnesio pabaigoje organizacija susumuoja stažuotojo ir jo pateisinamo nebuvimo darbe valandas, po to jas deklaruoja Mokėjimo paslaugų agentūrai. 3) Paslaugų ir mokėjimų agentūra, remdamasi stažuotojo byla ir jo dalyvavimo ataskaitomis, ASP apskaičiuoja už atitinkamą mėnesį mokėtiną sumą ir sumoka į stažuotojo sąskaitą. Pasibaigus operacijai, ASP pateikia regionui darbo užmokesčio pažymą, kurioje apibendrinami visi mokėjimai už kiekvieną stažuotoją.