A Vízgazdálkodási Alap pénzügyi eszközének célja az ivóvízellátás és a szennyvízkezelés rendelkezésre állásának és minőségének javítása a környezetnek a szennyvíz káros hatásaitól való védelme, a központosított rendszerekhez csatlakozó felhasználók számának és a központosított rendszerek felhasználóinak teljes számának növelése, a szolgáltatások minőségének és hatékonyságának javítása, valamint a hálózati veszteségek és balesetek csökkentése érdekében. Az előzetes értékelés elemzése szerint a vízgazdálkodási ágazatban a teljes finanszírozási hiány körülbelül 3,5 milliárd EUR. A Litván Köztársaság több mint 14 000 kilométernyi ivóvízellátást és több mint 10 000 kilométer szennyvízgyűjtő hálózatot üzemeltet, amelyek több mint fele 60%-os vagy annál nagyobb mértékben romlott, és nagyon alacsony a vízveszteség és a beszivárgás aránya. A lakosság ivóvízellátáshoz és szennyvízgyűjtő hálózatokhoz való kapcsolódása településenként jelentősen eltér – becslések szerint a hálózatba kapcsolt fogyasztók 95%-os arányának elérése érdekében a fogyasztók mintegy 13%-át az ivóvízhálózathoz kell csatlakoztatni, a fogyasztók 16%-át pedig a szennyvízhálózathoz kell csatlakoztatni. Az Alap hosszú távú (legfeljebb 20 éves) hitelt nyújt az engedéllyel rendelkező ivóvízszolgáltatóknak és szennyvízkezelőknek az ivóvízellátási és szennyvízgyűjtő hálózatok fejlesztésére és felújítására.