A technikai segítségnyújtási operatív program (RO OP TP), az esb-alapok igazgatási kapacitásával foglalkozó főosztály (ESIF AK), az esb-alapok irányítási és végrehajtási rendszerében részt vevő technikai segítségnyújtási operatív program kifizetési egysége (OPTP) a 2014–2020-as programozási időszakban a Szlovák Köztársaság 2014–2020-as partnerségi megállapodásának szintjén az esb-alapok irányítási és végrehajtási rendszerében részt vevő fizetési kiadások támogatása és visszatérítése alapvető előfeltétele az esb-alapok hatékony és eredményes irányításának és végrehajtásának. Az 519/2014. sz. szlovák kormányhatározat szerint a 2014–2020-as programozási időszakban az IH OP TP, PJ OP TP, AK ESIF látja el a szlovák kormányhivatal feladatait. A nemzeti hatóság, valamint a transznacionális együttműködési programokkal és az európai területi együttműködéssel foglalkozó nemzeti kapcsolattartó pont részt vesz az európai strukturális és beruházási alapok irányítási rendszerében a szlovák PD szintjén. Az Interreg Közép-Európa 2014–2020 európai területi együttműködési programok és a 2014–2020 közötti időszakra vonatkozó Interreg Duna transznacionális program fontos szerepet játszik a PD SR új operatív programjai keretében támogatandó területek meghatározásában. A Szlovák Köztársaság Kormányhivatala a 604/2013. sz. szlovák kormányhatározat értelmében a transznacionális együttműködési és európai területi együttműködési programok előkészítéséért és végrehajtásáért felelős szerv. A szlovák kormány 318/2014. sz. határozata jóváhagyta a Közép-Európa 2020 együttműködési programot, a szlovák kormány 34/2015. sz. határozatát pedig jóváhagyta a 2014–2020 közötti időszakra szóló Duna Transznacionális Programot. A nemzeti hatóság és a transznacionális együttműködéssel és az európai területi együttműködési programokkal foglalkozó nemzeti kapcsolattartó pont igazgatási kapacitásának támogatása a 2014–2020-as programozási időszakban előfeltétele a transznacionális együttműködési programok hatékony előkészítésének és végrehajtásának.