Mikro-organismit ja biologiset kudokset: tasapainosta patologiaan” pyritään kuvaamaan mikro-organismien (tai niiden tuottamien aineenvaihduntatuotteiden) ja biologisten kudosten välisten vuorovaikutusten merkitystä kolmessa yhteydessä: — normaali tilanne (solujen kasvu), – suoliston patologian tilanne (Crohnin taudin tyypin tulehdus), – siihen liittyvä suoliston ulkopuolinen patologinen tilanne (migreeni). Tämän hankkeen tavoitteiden saavuttamiseksi korkean resoluution kuvantaminen on olennaisen tärkeää. Kahden Clermontese-alustalle asennetun huippuluokan laitteiston hankinta on tullut välttämättömäksi ja ensisijaiseksi tavoitteeksi. Innovatiivinen lähestymistapa toteutetaan korreloimalla resoluution lisäämiseen käytettävien eri kuvantamistapojen (fotoninen/konfokaalinen/elektroninen) välinen korrelaatio. Lisätietoja tutkittavan mallin rakenteesta, toiminnasta, dynamiikasta (in vivo ja reaaliaikainen kuvantaminen) ja kemiallisesta koostumuksesta saadaan. Tämä jäsentelyhanke, johon osallistuu useita Clermontois-alueen yhteisiä tutkimusyksiköitä (GreD, Neuro-Dol, M2iSH, IMoST) ja siihen liittyviä alustoja (CICS, GReD-CLIC), pyrkii vastaamaan kysymyksiin, jotka ovat tällä hetkellä keskeisiä kysymyksiä suoliston mikrobiston ja sen metaboliittien roolissa fysiologiassa ja patologiassa.