KRNAP ja sen toimenpideohjelma ovat alue, josta useat vesistöt ovat peräisin. Hankkeessa tehdään laaja-alainen analyysi, jossa keskitytään näiden vesistöjen ja niiden vesistöalueiden arviointiin. Tämän kattavan analyysin perusteella ehdotetaan toimenpiteitä vesistöalueisiin ja vesistöihin niiden suotuisan tilan ja erityisesti maisemavesien säilyttämisen varmistamiseksi. Kaikki toimenpiteet suunnitellaan niin lähellä luontoa, ja ne vastaavat suojelukohteita EVL Krkonoše ja lintualue Giant Mountains.