Atlantin alueen luonnonvarat poikkeavat pohjoisesta etelään, ja niiden tutkiminen kokonaisuudessaan on olennaisen tärkeää, jotta uusia teknologioita voidaan mukauttaa käytettävissä oleviin resursseihin. SEAFUELin tavoitteena on osoittaa, että eristyneillä alueilla on mahdollista käyttää paikallisia liikenneverkkoja käyttämällä saatavilla olevia uusiutuvia energialähteitä, kuten aurinko-, tuuli- ja merienergiaa. Eristyneillä alueilla, kuten saarilla, on erityinen haaste, joka johtuu sähkön ja polttoaineen korkeista kustannuksista ja niiden riippuvuudesta mantereen infrastruktuureista. SEAFUEL keskittyy näihin alueisiin, joissa 30 prosenttia polttoaineenkulutuksesta on peräisin paikallisliikenteestä. Saarille kehitetään vaihtoehtoisten polttoaineiden malli, joka täyttää kumppaneiden alueellisten innovaatiostrategioiden (RIS3) vaatimukset, joiden tavoitteena on vähähiilinen talous ja merten luonnonvarojen tehokas käyttö. Hankkeella vähennetään merkittävästi kasvihuonekaasupäästöjä, hiukkasia ja typpidioksidia puhtaan ilman ohjelman 2008/50/EY mukaisesti ja tarjotaan eristyneille alueille mahdollisuus tulla energeettisesti riippumattomiksi, mikä johtaa tuleviin laitoksiin muilla Atlantin alueilla. SEAFUEL keskittyy edistämään vihreää kasvua ja sinistä taloutta sekä luomaan pohjaa yhteisille uusiutuvaa energiaa koskeville politiikoille puhtaiden ja kestävien liikennejärjestelmien edistämiseksi.