Slovenialla on suuri ilmansaasteiden ongelma, sillä se on yksi niistä maista, joissa on Euroopan laajuisesti eniten saastunutta ilmaa. Tämä johtuu pääasiassa puun massiivisesta käytöstä vanhentuneissa kotitalouksien polttolaitoksissa sekä intensiivisestä kauttakulusta ja paikallisesta maantieliikenteestä. Lisäksi päästöjen väheneminen voi johtaa liialliseen ilman pilaantumiseen, koska lämpötila on usein ja voimakkaasti inversioita ja useimpien Slovenian alueen esiintyvyys on vähäistä, ja on arvioitu, että liian saastuneilla alueilla ilmansaasteista johtuva elinajanodote on noin vuosi lyhyempi. Sloveniassa alueilla, joilla ilmassa on liikaa PM10-hiukkasia, asuvan väestön osuus on huomattavasti suurempi kuin EU:n keskiarvo. Terveysvaikutusten arvioinnit osoittavat, että liian saastuneiden alueiden hiukkaspitoisuuksien ohjeellinen puolittaminen Sloveniassa nostaisi elinajanodotetta puoleen vuoteen.