KASVIEN BAKTEERITAUDIT AIHEUTTAVAT MERKITTÄVIÄ TALOUDELLISIA TAPPIOITA; NIIDEN VALVONTA ON VAIKEAA, JA SEN ODOTETAAN TULEVAISUUDESSA OLEVAN VAIKEAMPAA, KOSKA EU:SSA ON RAJOITUKSIA SELLAISTEN TEHOAINEIDEN HYVÄKSYNNÄLLE, JOTKA OVAT SAATAVILLA YHDENNETTYYN VALVONTAAN. PSEUDOMONAS SAVASTANOI PV. SAVASTANOI (PSV) TUOTTAA ILMAN KASVAIMIA ISÄNTÄ, AIHEUTTAA YKSI TÄRKEIMMISTÄ OLIIVIN TAUTEJA, VAIKKA SE ON MYÖS PATOGEENINEN MONISSA KASVILAJEISSA. LISÄKSI PSV ON ÄSKETTÄIN PALJASTUNUT NOUSEVAKSI TAUDINAIHEUTTAJAKSI KORISTELAJISSA MANDEVILLA SANDERI (DIPLADENIA). P. SAVASTANOI PV. PHASEOLICOLA (PPH) ON TALOUDELLISESTI TÄRKEÄ TAUDINAIHEUTTAJA JUDIASSA JA YKSI MERKITTÄVIMMISTÄ TUTKIMUSMALLEISTA FYTOBAKTERIOLOGIASSA. YKSI TOIVOTTAVIMMISTA PPH-VALVONTASTRATEGIOISTA ON VASTUSTUSKYKYISTEN JUUTALAISTEN LAJIKKEIDEN KÄYTTÖ. PPH-ISOLAATIT LUOKITELLAAN YHDEKSÄÄN ROTUUN NIIDEN VUOROVAIKUTUKSEN MUKAAN 8 ERI JUUTALAISLAJIKKEEN KANSSA, JOTKA ON SELITETTY 5 PARIN VUOROVAIKUTUKSELLA GEENI-GEN-SUHTEESSA, VAIKKA ON MAHDOLLISTA TEHDÄ SUUREMPI EROTTELU JOPA 14 RODUSSA. MOLEMMAT PATOJÄRJESTELMÄT TARJOAVAT ENNENNÄKEMÄTTÖMÄN MAHDOLLISUUDEN TUTKIA VIERAIDEN SPESIFISYYDEN MOLEKYYLIPOHJAA. YHTÄÄLTÄ, VAIKKA PPH ON GENEETTISESTI HOMOGEENINEN PATOVAR, ERI ISOLAATTIEN VIRULENSSI ON ERILAINEN, MIKÄ KUVASTAA NIIDEN ROTUSPESIFISYYTTÄ. TOISAALTA, ERI PATOVARES P. SAVASTANOI AIHEUTTAA SAMANLAISIA OIREITA (KASVAIMIA) SEKÄ WOODY JA RUOHO ISÄNNÄT. PPH 1448A- JA PSV NCPPB 3335 -KANTOJEN SULJETTUJEN GENOMIEN SAATAVUUS SEKÄ AIEMPIEN PROJEKTIEMME AIKANA KEHITETYT GENEETTISET JA TOIMINNALLISET TYÖKALUT TEKEVÄT NÄISTÄ BAKTEEREISTA IHANTEELLISIA MALLEJA VIERASSPESIFISYYDEN JA VIRULENSSIN KEHITTYMISEN ANALYSOINTIIN. NÄIN OLLEN FYLOGENEETTISESTI SAMANKALTAISTEN BAKTEERIKANTOJEN VERTAILEVA JA TOIMINNALLINEN GENOMIANALYYSI HELPOTTAA PATOGEENISUUDEN TAUSTATEKIJÖIDEN TUNNISTAMISTA PATOVAR- JA ROTUTASOLLA. HANKKEEN PÄÄTAVOITTEET OVAT SEURAAVAT: 1) TUNNISTAA JA LUONNEHTIA TOIMINNALLISESTI EROT PSV-PATOVAREIDEN JA PPH-ROTUJEN VIRULENSSIGEENEISSÄ, JOTKA LIITTYVÄT ISÄNTÄSPESIFISYYTEEN; JA 2) SOVELTAA VERTAILEVALLA JA TOIMINNALLISELLA GENOMILLA SAATUJA TIETOJA PPH-ROTUJEN DIAGNOSTISTEN TYÖKALUJEN JA MANDEVILLASSA KEHITTYVÄN ERILLISEN PSV:N KEHITTÄMISEKSI. ERITYISTAVOITTEET OVAT SEURAAVAT: 1) ANTAA PATOVAR P. SAVASTANOI KANTOJA ERISTETTY M. SANDERI. 2) SEKVENSSI JA TALLENTAA EDUSTAVIA KANTOJA PATOVARS JA ROTUJEN P. SAVASTANOI. 3) SUORITA VERTAILEVA GENOMIANALYYSI JA FYLOGENEETTINEN ANALYYSI PSV-PATOVAREISTA JA PPH-RODUISTA. 4) TUTKIA BIOLOGIAN JA ROOLIN SPESIFISYYS ISÄNTÄ PLASMAIDS NÄIDEN BAKTEERIKANTOJEN. 5) SYVENTÄÄ ERITYSJÄRJESTELMIEN VIERASSPESIFISYYTTÄ, TYYPIN III ERITYSJÄRJESTELMÄN VAIKUTTAJIA JA 6) MUITA VIRULENSSITEKIJÖITÄ. 7) TUTKIA GEENISEN ILMENTYMÄN ROOLIA VIERAIDEN SPESIFISYYDESSÄ. 8) KEHITTÄÄ ERITYISIÄ DIAGNOSTISIA TYÖKALUJA MANDEVILLA ISOLAATTEJA JA PPH ROTUJA.
