Hankkeen tavoitteena on suojella Natura 2000 -alueita suojellun laitoshoidon avulla antamalla presidentin asetuksia. Kansallisen lainsäädännön mukaisesti suojelualueen perustaminen ja hoito edellyttää ensin erityisen ympäristötutkimuksen laatimista, jonka perusteella laaditaan ohjelma-asiakirja, jonka ehdoissa määritellään hoitosuunnitelma. Hankkeen yhteydessä toteutetaan tarvittavat maan Natura-alueiden kansalliset uudistusohjelmat, ohjelma-asiakirjat ja vaikutustenarvioinnit (11 alueella) kansallisen lainsäädännön täytäntöönpanemiseksi sekä niiden suojelemiseksi ja hallinnoimiseksi tehokkaasti.