ESR II ČZU:ssa on kattava hanke, jonka tavoitteena on parantaa koulutustoiminnan laatua, ottaa käyttöön käytäntöjä opinto-ohjelmissa, lisätä SP-opiskelijoiden osallistumista koulutukseen, kansainvälistää ČZU-ympäristö, kehittää yhteyksiä korkeakoulututkinnon suorittaneiden välillä työmarkkinoilla valmistuneiden soveltamiseksi. Tavoitteena on toteuttaa yliopisto-opintojen strategista johtamista sekä toimia, jotka lisäävät kiinnostusta opiskella ČZU:ssa opiskelijoiden joukossa. Tärkeää on hankkeen yhteys EAKR:n täydentäviin hankkeisiin.