Τα Καρπάθια και οι Άλπεις ανήκουν στις σημαντικότερες φυσικές περιοχές της Ευρώπης. Ο χαρακτηρισμός του διαδρόμου Άλπεων-Καρπαθίων εξασφάλισε τη διασφάλιση της οικολογικής σύνδεσης μεταξύ αυτών των μεγάλων περιοχών. Η συνδεσιμότητα ενδιαιτημάτων για τους υδρόβιους οργανισμούς στην αυστροσλοβακική παραμεθόρια περιοχή θα πρέπει επίσης να προστατευθεί και να βελτιωθεί στο πλαίσιο του διαδρόμου του ποταμού Άλπεων των Καρπαθίων. Οι μεγάλες προστατευόμενες περιοχές (Donau-Auen, Zahorie, Wienerwald, Morava) στη μητροπολιτική περιοχή Βιέννης-Μπρατισλάβας έχουν εξαιρετική σημασία για τη διατήρηση της φύσης και την τοπική αναψυχή. Ωστόσο, μπορούν να επιτύχουν τους στόχους προστασίας τους μόνο εάν παραμείνουν συνδεδεμένοι μέσω διαδρόμων οικοτόπων. Το δίκτυο των πλωτών οδών διαδραματίζει σημαντικό ρόλο στην προστασία αυτή. Οι κανονισμοί, οι εγκάρσιες δομές, η αδύναμη δομή των χαμηλών δασών και η εντατική γεωργία στη γύρω περιοχή επηρεάζουν την πολυλειτουργικότητα τους. Οι έννοιες διασυνοριακής προστασίας και φροντίδας για επιλεγμένους ποταμούς (Rudava, Malina, Myjava, Mociarka στη Σλοβακία, Schwechat και Fischa στην Αυστρία) αναπτύσσονται από κοινού από εμπειρογνώμονες και από τις δύο χώρες. Τα πιλοτικά μέτρα αναζωογόνησης βελτιώνουν την ποιότητα των οικοτόπων των ποταμών και συμβάλλουν στην προστασία από τις πλημμύρες στην περιοχή. Η επιτυχία των μέτρων που υλοποιήθηκαν τεκμηριώνεται με βάση επιλεγμένα είδη (Kingfisher, Common Nase, Dice Snake, Ουκρανικό Brook Lamprey). Η συμμετοχή των γειτονικών κοινοτήτων, των ενδιαφερόμενων μερών και των σχολείων στις δραστηριότητες του έργου θα πρέπει να καταστήσει τους ποταμούς της μεθοριακής περιοχής Αυστρίας-Σλοβακίας πιο απτούς και να αναζωπυρώσει τον ενθουσιασμό για τον οικότοπο του ποταμού.