Α) ΣΤΟΧΟΣ αριθ. 2 — Στόχος του έργου είναι η προώθηση της εγχώριας δομικής χημείας και της δομικής βιολογικής έρευνας, η υποστήριξη της έναρξης νέων δραστηριοτήτων βασικής έρευνας και καινοτομίας αιχμής μέσω της επέκτασης των υφιστάμενων υποδομών περίθλασης ακτίνων Χ. Η τρέχουσα υποδομή αποτελείται από εξοπλισμένα εργαστήρια κρυστάλλωσης, κρυσταλλικό ρομπότ και ένα παρωχημένο περίφραγμα κατάλληλο για δοκιμές πρωτεϊνικής δομής. Η σχεδιαζόμενη ανάπτυξη, η απόκτηση ενός περιθλακτόμετρου με περιστροφικό ανόδιο και υπερσύγχρονο ανιχνευτή υβριδικών εικονοστοιχείων, θα επέτρεπε την επέκταση του φάσματος εφαρμογών με τη βοήθεια μιας νέας συσκευής με μοναδική ευαισθησία στην Ουγγαρία. Η σημασία των ερευνών περίθλασης ακτίνων Χ — Το καλά ρυθμιζόμενο δίκτυο αλληλεπίδρασης των μορίων διαδραματίζει αναπόφευκτη ρόλο στη λειτουργία του ζωντανού οργανισμού, συμπεριλαμβανομένων των αλληλεπιδράσεων και των μόνιμων ή μεταβατικών συμπλοκών πρωτεϊνών μεταξύ τους και με άλλα μόρια. Η τρισδιάστατη αναπαράσταση διαδραματίζει σημαντικό ρόλο στην κατανόηση αυτών των διαδικασιών. Περίθλαση ακτίνων Χ — όπου η επιτυχία της μέτρησης, το περιεχόμενο πληροφοριών των μετρούμενων δεδομένων εξαρτάται τόσο από την ποιότητα του ελεγχόμενου κρυστάλλου όσο και από την υπερσύγχρονη τεχνολογία της συσκευής περίθλασης, είναι ένα από τα κύρια εργαλεία για τη χωρική εξέταση των μορίων, των μοριακών συμπλοκών και των αλληλεπιδράσεων με ατομικές λεπτομέρειες. The Focal Points of RESEARCH — Το έργο συγκεντρώνει διεπιστημονική έρευνα, εστιάζοντας στις ατερματικές αλληλεπιδράσεις, τον ατομικό χαρακτηρισμό και το σχεδιασμό προτύπων χωρικής αλληλεπίδρασης σε πρωτεϊνικά σύμπλοκα και μικρούς κρύσταλλους μορίων. Ένας από τους κύριους στόχους της έρευνάς μας είναι να κατανοήσουμε καλύτερα την πρωτεϊνική λειτουργία και τα δανειζόμενα πρωτεϊνικά δίκτυα, να χαρτογραφήσουμε τις τροποποιημένες ιδιότητες δομικής αλληλεπίδρασης των πρωτεϊνικών παραλλαγών και των μεταβολών των πρωτεϊνών που σχετίζονται με ασθένειες, να βοηθήσουμε στο σχεδιασμό των δεσμών και των πρωτεϊνών (liable πεπτιδικά μοτίβα). 1) Χημική τροποποίηση της πρωτεΐνης που σχετίζεται με ασθένειες (π.χ. οξείδωση είναι η πρωτεΐνη DJ-1 που εκτελεί την προστατευτική λειτουργία ενάντια στη νόσο του Parkinson. σημειακές μεταλλάξεις στην περίπτωση ενζύμου υπεύθυνου για την παραγωγή ψευδοουριδίνης που εμπλέκεται στη βελτίωση της δομής του RNA) και κατανόηση των μεταβολών δομής και αλληλεπίδρασης που προκύπτουν από αυτές, προκειμένου να αποσαφηνιστούν τα δομικά στοιχεία της λειτουργίας. Επιπλέον, στόχος μας είναι να παρέχουμε αποτελεσματική βοήθεια στο σχεδιασμό συγκεκριμένων συνδέσμων (σε συνδυασμό με εξαιρετικά διαπερατές μεθόδους) και στη χρήση προηγμένων συνδέσμων ως υποψήφιων δραστικών ουσιών ή μοριακών αισθητήρων (π.χ. DJ-1 και D-αμινοξέα οξειδάση). Το περίφραγμα που λαμβάνεται συλλέγει επίσης τακτικά δεδομένα μέτρησης υψηλής ποιότητας από λιγότερο διασκορπιζόμενους κρυστάλλους, γεγονός που επιταχύνει τη διαδικασία σχεδιασμού. 2) Με συγκεκριμένη αναστολή της μη φυσιολογικής ενεργοποίησης του ανοσοποιητικού συστήματος, μπορούν να αναπτυχθούν μόρια αναστολέων που μπορούν να χρησιμοποιηθούν στην ιατρική ή σε μια λεπτομερέστερη εξέταση των οδών ενεργοποίησης (π.χ. σύστημα συμπληρώματος). Με την υποδομή περίθλασης ακτίνων Χ, θέλουμε να κατανοήσουμε την ιδιαιτερότητα και την επιλεκτικότητα αυτών των νέων μορίων πρωτεϊνικού αναστολέα που αναπτύχθηκαν με κατευθυντική εξέλιξη. 3) Μεταξύ των προτύπων αλληλεπίδρασης πρωτεΐνης-πρωτεΐνης, οι αλληλεπιδράσεις των πρωτεϊνών κόμβου είναι επίσης σημαντικές από ιατρική άποψη, οι οποίες χαρακτηρίζονται από την αναγνώριση διαφόρων δανείσιμων κινήτρων, επηρεάζοντας έτσι σημαντικά τις φυσιολογικές διεργασίες επηρεάζοντας τη λειτουργία πολλών πρωτεϊνικών εταίρων (π.χ. πρωτεΐνες S100 που εμπλέκονται στη μετάσταση, ή κινάσες MAP, κινάσες τυροσίνης που ελέγχουν την κυτταρική διαίρεση και τις διαδικασίες κίνησης που εμπλέκονται σε διεργασίες μετάδοσης σήματος). Η χημική αλλαγή των δανειζόμενων πρωτεϊνικών επιφανειών (π.χ. φωσφορυλίωση) είναι καθολική στη ρύθμιση των διαδικασιών μετάδοσης σήματος, συχνά στο πλαίσιο παθολογικών διεργασιών. 4) Στην περίπτωση των αυτοοργανωμένων, πολυμερών πρωτεϊνών που διαχωρίζουν τη χημική αντίδραση που καταλύουν από τον έξω κόσμο με ένα σύστημα κοιλότητας, έτσι πιθανοί στόχοι για βιοτεχνολογικές εφαρμογές, στόχος μας είναι να εντοπίσουμε και να χαρακτηρίσουμε δομικά στοιχεία σημαντικά για την αυτοοργάνωση πρωτεϊνών (ολιγοπεπτιδάσες). 5) Καθορίζοντας τη δομή των μικρών μορίων, ένας από τους στόχους μας είναι ο προσδιορισμός υψηλής ακρίβειας των μορίων, από τα οποία μπορούμε να συμπεράνουμε την αλλαγή της αντιδραστικότητας μέσα σε μια σειρά ενώσεων στην περίπτωση των βιολογικώς ενεργών ενώσεων (π.χ. παράγωγα σιδηροκενίου, ενώσεις με κυτταροστατική δράση). 6) Επιλεκτική, Kiral αναγνώριση των δανειζόμενων εταίρων είναι απαραίτητη για τη λειτουργία των βιολογικών συστημάτων. Στην παραγωγή βιοενεργών μορίων, ως εκ τούτου, ο αποτελεσματικός διαχωρισμός των...