Η CGET είναι υπεύθυνη για τον συντονισμό των Ευρωπαϊκών Διαρθρωτικών και Επενδυτικών Ταμείων που προβλέπεται στο άρθρο 123 του γενικού κανονισμού της Ευρωπαϊκής Ένωσης και στη συμφωνία εταιρικής σχέσης, σε συνεργασία με τη Γενική Γραμματεία Ευρωπαϊκών Υποθέσεων. Σύμφωνα με το άρθρο 117 παράγραφος 1 του γενικού κανονισμού, είναι αρμόδια για τον συντονισμό των δραστηριοτήτων πληροφόρησης και επικοινωνίας που αφορούν ένα ή περισσότερα ταμεία. Σύμφωνα με το άρθρο 72 παράγραφος 2 του «γενικού κανονισμού», η SYNERGY, Σύστημα Πληροφοριών (IS) για τα Ευρωπαϊκά Ταμεία, αποτελούμενη από διαφορετικές εφαρμογές με επιμερισμένη διαχείριση, επιτρέπει την παρακολούθηση των κονδυλίων, των προγραμμάτων και της συμφωνίας εταιρικής σχέσης κατά την περίοδο προγραμματισμού 2014-2020. Για το ΕΤΠΑ και το ΕΚΤ, η SYNERGIE είναι υπεύθυνη για τη διεύθυνση, την παρακολούθηση, τη διαχείριση, την πιστοποίηση, τον έλεγχο και τον λογιστικό έλεγχο. Ωστόσο, μπορούν να δημιουργηθούν συστήματα πληροφοριών από τις διαχειριστικές αρχές για τις μονάδες διαχείρισης, τη διεύθυνση, την παρακολούθηση και την πιστοποίηση των προγραμμάτων τους, ενώ ο εθνικός έλεγχος, ο λογιστικός έλεγχος και η διεύθυνση πρέπει να διενεργούνται στο SYNERGIE. Η πράξη αυτή καλύπτει τη χρηματοδότηση της θέσης διευθυντή του προγράμματος Presage-Synergie και τυχόν συναφείς δαπάνες, καθώς και τις έμμεσες δαπάνες που συνδέονται με τη θέση αυτή για τα έτη 2016 έως 2019.