Η ομάδα φιλοξενίας μας EA2656, GRAM 2.0 (Στρατιωτική Ομάδα Έρευνας για την Προσαρμογή) είναι μια μοναδική ομάδα, bi-site in cotutal μεταξύ των πανεπιστημίων του Caen και της Rouen. Είναι μέλος του Federation Hospitalo-Universitaire (FeNOMIH) που συγκεντρώνει τις υπηρεσίες βακτηριολογίας, ιολογίας, παρασιτολογίας/μυκολογίας, νοσοκομειακής υγιεινής και μολυσματολογίας των CHU του Caen και της Rouen. Η ομάδα GRAM 2.0 έχει 2 Εθνικά Κέντρα Αναφοράς Μεταδοτικές Ασθένειες (ιλαρά/παραθαλάσσια/Ρουμπέλα, HIV). Ως εκ τούτου, διαθέτει πολλά περιουσιακά στοιχεία για την αποτελεσματική επίτευξη των στόχων του έργου DynaMic-H. Σε αυτά τα περιουσιακά στοιχεία προστίθεται η ενσωμάτωση σε αυτό το έργο των τμημάτων γενικής ιατρικής του UFR Santé του Caen και της Rouen, που συμμετέχουν στη δειγματοληψία και τη συλλογή δεδομένων στην πρωτοβάθμια περίθαλψη. Πρόκειται για ένα δίκτυο επαγγελματιών υγείας σε επαφή με τον γενικό πληθυσμό, πολύτιμο για να περιγράψει το πλαίσιο της απόκτησης παθογόνων στην πρωτοβάθμια περίθαλψη. Το έργο DynaMic-H βασίζεται σε μια ολοκληρωμένη προσέγγιση στη λοιμώδη παθολογία λαμβάνοντας υπόψη την επίδραση της δυναμικής των αλλαγών στην ισορροπία των μικροβιωμάτων. Αυτές οι κοινότητες μικροβιακών ειδών αποικίζουν τον οργανισμό μας καθ’ όλη τη διάρκεια της ζωής. Αλληλεπιδρούν σημαντικά με τις φυσιολογικές μας δραστηριότητες, ιδιαίτερα με τα ανοσοποιητικά, μεταβολικά και νευρογνωστικά συστήματα. Αυτό το ερευνητικό έργο επικεντρώνεται στο ανθρώπινο μικροβιομέτρο (ή μικροβιώτα), το οποίο ορίζεται ως όλα τα βακτήρια, ιοί, μύκητες και άλλοι μικροοργανισμοί που υπάρχουν στα διάφορα τμήματα ή οικολογικές κόγχες του οργανισμού μας. Το έργο DynaMic-H στοχεύει στη μελέτη των μικροβιωμάτων και των αλληλεπιδράσεών τους με ιογενείς και βακτηριακές λοιμώξεις. Λόγω των τομέων εμπειρογνωμοσύνης των μελών του GRAM 2.0, το κύριο συστατικό είναι το στοματοφαρυγγικό αναπνευστικό μικροβιομέτρο και περιλαμβάνει επίσης δύο πιλοτικές μελέτες, στις οποίες συμμετέχουν το εντερικό διαμέρισμα και το ουροποιητικό/κολπικό διαμέρισμα.Τα δείγματα θα επιλεγούν και θα προετοιμαστούν για υψηλής χρέωσης μετα-μεταγραφική αλληλουχία χωρίς a priori βελτιστοποιημένη μικτή βελτιστοποιημένη (μακρές ακολουθίες και σύντομη τεχνολογία Nanopore και Illumina αντίστοιχα) επιτρέποντας τη βιοπληροφορική ανάλυση της αφθονίας και της λειτουργικής έκφρασης μικροβιακών γονιδίων. Οι πολυμεταβλητές αναλύσεις δεδομένων υψηλής ροής θα προσδιορίζουν τα προφίλ που σχετίζονται με τις μεταβλητές που υποβλήθηκαν σε δοκιμή. Θα βασίζονται σε αγωγούς βιοπληροφορικής που έχουν αναπτυχθεί και είναι ήδη διαθέσιμες, προσαρμοσμένες υπολογιστικές και αποθηκευτικές ικανότητες που είναι διαθέσιμες σε τοπικό επίπεδο, και ήδη διαθέσιμες μεταγραφικές και (μετα)γονιδιωματικές των πιλοτικών σχεδίων και συνεργατών.
