Το Υπουργείο Οικονομικών της Σλοβακικής Δημοκρατίας εγκρίθηκε με το κυβερνητικό ψήφισμα αριθ. 318/2013 ως αρχή πιστοποίησης για τα επιχειρησιακά προγράμματα της περιόδου προγραμματισμού 2014-2020 που χρηματοδοτούνται από το Ευρωπαϊκό Ταμείο Περιφερειακής Ανάπτυξης, το Ευρωπαϊκό Κοινωνικό Ταμείο, το Ταμείο Συνοχής και το Ευρωπαϊκό Ταμείο Θάλασσας και Αλιείας, συμπεριλαμβανομένων των προγραμμάτων του στόχου της ευρωπαϊκής εδαφικής συνεργασίας στα οποία η Σλοβακία εκπληρώνει τον ρόλο της διαχειριστικής αρχής. Η αρχή πιστοποίησης εκπληρώνει το ρόλο του φορέα που είναι αρμόδιος για τον συντονισμό και την καθοδήγηση των φορέων που συμμετέχουν στο σύστημα δημοσιονομικής διαχείρισης, την κατάρτιση των λογαριασμών, την κατάρτιση των αιτήσεων πληρωμής και την υποβολή τους στην Ευρωπαϊκή Επιτροπή, την είσπραξη πληρωμών από την Ευρωπαϊκή Επιτροπή, την εκκαθάριση των οικονομικών σχέσεων (ιδίως για παρατυπίες και δημοσιονομικές διορθώσεις) με την Ευρωπαϊκή Επιτροπή και σε εθνικό επίπεδο, καθώς και την πραγματοποίηση πληρωμών σε επιμέρους προγράμματα. Το έργο αυτό αποσκοπεί στη χρηματοδότηση του κόστους εργασίας για τη διοικητική ικανότητα, καθήκον της οποίας είναι να διασφαλίζει την ποιοτική απόδοση των καθηκόντων του οργανισμού πιστοποίησης.