Hlavním cílem je zajistit hladké a účinné provádění operačních programů: POIG, POKL a POPC. POPT poskytuje finanční zdroje na řízení procesů v oblasti přípravy, řízení, provádění, monitorování, hodnocení a kontroly provádění, jakož i na informování a propagaci programů Unie.
