Projekt „Mikroorganismy a biologické tkáně: od rovnováhy k patologii" se zaměří na popis úlohy interakcí mezi mikroorganismy (nebo metabolity, které produkují) a biologickými tkáněmi ve třech kontextech: — normální situace (růst buněk), – situace střevní patologie (zánět typu Crohnovy choroby), – přidružená mimointestinální patologická situace (migréna). Pro splnění cílů tohoto projektu je nezbytné zobrazování s vysokým rozlišením. Pořízení nejmodernějšího vybavení instalovaného na 2 Clermontese platformách se stalo nutností a prioritou. Inovativní přístup bude zaveden korelacem různých způsobů zobrazování zvyšujícího se rozlišení (fotonické/konfokální/elektronické). Další informace o struktuře, funkci, dynamice (in vivo a zobrazení v reálném čase) a chemickém složení studovaného modelu lze získat. Tento strukturovací projekt zahrnující několik společných výzkumných jednotek (UMR) Clermontois site (GreD, Neuro-Dol, M2iSH, IMoST) a přidružených platforem (CICS, GReD-CLIC) si klade za cíl odpovědět na otázky, které jsou v současné době klíčovými body v oblasti role střevní mikrobioty a jejích metabolitů na fyziologii a patologii.