Finanční nástroj fondu pro hospodaření s vodou se zaměří na zvýšení dostupnosti a kvality dodávek pitné vody a nakládání s odpadními vodami s cílem chránit životní prostředí před škodlivými účinky odpadních vod, zvýšit počet uživatelů připojených k centralizovaným systémům a celkový počet uživatelů centralizovaných systémů, zlepšit kvalitu a účinnost služeb a snížit ztráty a nehody v sítích. Podle analýzy předběžného posouzení činí celková mezera ve financování v odvětví vodního hospodářství přibližně 3,5 miliardy EUR. Litevská republika provozuje více než 14 000 kilometrů dodávek pitné vody a více než 10 000 kilometrů sběrných sítí odpadních vod, z nichž více než polovina se zhoršila nejméně 60 % a vykazuje velmi nízkou míru ztrát vody a pronikání. Připojení obyvatelstva k dodávkám pitné vody a sběrným sítím odpadních vod se v jednotlivých městech značně liší – odhaduje se, že má-li být dosaženo 95 % podílu připojených spotřebitelů, musí být přibližně 13 % spotřebitelů připojeno k sítím pitné vody a 16 % spotřebitelů musí být připojeno k kanalizační síti. Fond poskytne licencovaným veřejným dodavatelům pitné vody a správcům odpadních vod dlouhodobé půjčky (až 20 let) na rozvoj a renovaci sítí pro dodávky pitné vody a odvádění odpadních vod.