V souladu s ustanoveními § 5 zákona o příspěvcích z ESI fondů a § 24 kompetenčního zákona je Státní úřad Slovenské republiky orgánem odpovědným za ochranu finančních zájmů. Úlohu ochrany finančních zájmů EU v rámci SR OV zajišťuje ústřední kontaktní jednotka úřadu OLAF (OLAF). Orgánem zajišťujícím ochranu finančních zájmů je koordinační jednotka pro boj proti podvodům podle čl. 3 odst. 4 nařízení č. 883/2013. Podpora správní kapacity koordinátora pro boj proti podvodům v programovém období 2014–2020 je nezbytným předpokladem pro dosažení koordinace činností zaměřených na boj proti podvodům a ochranu finančních zájmů EU na Slovensku.