Cílem fondu pro podnikání II je vytvořit finanční nástroje (úvěrový fond, záruční fond atd.) s cílem posílit ekonomicky životaschopné střední a malé podniky a mikropodniky. Je určen podnikům všech právních forem, které jsou v jakékoli fázi činnosti (stávající, začínající a zakládání). Finanční nástroje fondu se týkají poskytování úvěrů a záruk za výhodných podmínek podnikům na pokrytí nákladů na založení nebo rozvoj podniků, provádění investic, uspokojování potřeb likvidity, posílení extroverze a vytváření nových konkurenčních produktů a služeb.