ECOSS vispārējais mērķis ir izveidot ekoloģiskās novērošanas sistēmu Adrijas jūrā (ECOAdS), kas ir kopīga Itālijai un Horvātijai un kas spēj integrēt ekoloģiskos un okeanogrāfijas pētījumus un monitoringu ar Natura 2000 saglabāšanas stratēģijām. Pamatojoties uz iekārtām, infrastruktūru un ilgtermiņa ekoloģiskajiem datiem, kas pastāv programmas teritorijā, un izstrādājot īpašus gadījumu pētījumus, ECOSS uzlabos jūras novērošanas spējas, lai uzlabotu Natura 2000 tīkla jūras komponenta aizsardzības statusu un paplašināšanu. Tiks novērtēta sinerģija un atgriezeniskā saite starp galvenajiem saglabāšanas pārvaldības jautājumiem, ekoloģiskajiem mainīgajiem lielumiem un galvenajiem okeanogrāfiskajiem procesiem, pamatojoties uz dzīvotņu un sugu savienojamību piekrastes un jūras ūdeņos.
