Projekta mērķis ir pētīt reto slimību patoģenēzi ar jaunām diagnostikas metodēm, kas pašas par sevi ir paradigmas maiņa un pievienotā vērtība, jo tehnoloģiskais progress ir būtiski mainījis diagnostikas efektivitāti šajā jomā. Saskaņā ar Starptautiskā reto slimību konsorcija mērķiem un organizējot sadarbību izcilības jomā, projekta mērķis ir turpināt terapiju. Viens no galvenajiem šīs pētniecības programmas jauninājumiem ir tas, ka, sinerģiski koordinējot Ungārijas progresīvo pētniecības jaudu, tas rada iespējas klientam turpmāk piedalīties vietējā un starptautiskā sadarbībā, publicēt vadošajos žurnālos (Q1, D1 kvalitāte) šajā jomā un radīt virkni jaunu pētniecības un izstrādes notikumu. Rezultāti sniegs starptautiski unikālu iespēju izprast reto slimību patoģenēzi, izstrādāt jaunas diagnostikas un terapeitiskās procedūras, integrēt tās klīnikā ilgtermiņā un tādējādi nodrošināt rezultātu ilgtermiņa ilgtspēju. Tiek izstrādāta Ungārijas klīniskā eksom datu banka, kas ir būtiska individualizētas diagnostikas un dziedināšanas izstrādei, kā arī modernu fundamentālu un farmaceitisku pētījumu izstrādei, pamatojoties uz ģenētisku pamatu. Saskaņā ar iepriekš minēto projekta izveidotā genoma līmeņa datubāze atbalstīs arī gaidāmo veselības aprūpes sistēmas paradigmas maiņu pēc tam, kad būs izveidoti atbilstoši regulatori. Saskaņā ar to genomisko datu izmantošana ikdienas dziedniecībā un ģimenes plānošanā ievērojami palielinās terapeitisko drošību un samazinās nopietnu ģenētisko slimību sastopamību. Tā kā veselības politikas mērķis ir izstrādāt un augšupielādēt valsts veselības informācijas sistēmu, no šā projekta iegūtie dati ir labs izmēģinājuma projekts. Projekta metodoloģijas ziņā vismodernākās molekulārās bioloģiskās, bioinformātikas, molekulārās ģenētiskās, bioķīmiskās, šūnu un cilmes šūnu bioloģijas un in vivo dzīvnieku modeļa metodes, izmantojot plašu metodoloģisko spektru (piemēram, inducētu pluripotento cilmes šūnu tehnoloģiju, kas pārsniedz “modernāko” in vitro), sasniedz paredzētos mērķus. Fundamentālajos pētījumos iesaistīto pētnieku integrācija ir būtiska arī sekmīgai sadarbībai starp atsevišķiem centriem (reto slimību aprūpes tīkls), jo viņu pētniecības joma iekļaujas tematā un ar savām zināšanām var veicināt klīnisko tīklu optimālu darbību. B) Izpildīto REPUBLIKAs pētniecības pasākumu partikulācija ir balstīta uz trim galvenajiem pīlāriem: pētījumi par patoģenēzi, retu slimību diagnostiku un terapiju. Pētniecības projekts tiks īstenots Szeged Universitātē SZTE Medicīnas ģenētikas institūtā, SZTE Iekšējās medicīnas un kardioloģijas centrā, SZTE Bērnu klīnikā un bērnu centrā, kā arī Ungārijas Zinātņu akadēmijas Bioķīmijas un ģenētikas institūtā, Debrecenas Universitātē, DE reto slimību ekspertu centrā, Klīniskās ģenētikas katedrā un Pēča Universitātē Medicīnas ģenētikas institūtā, Medicīnas bioķīmijas institūtā un neiroloģiskajā klīnikā. I. RETO SLIMĪBU PATOĢENĒZES PĒTĪJUMI I/1. 1. uzdevums: (dati iekavās norāda iekļaujamo pacientu skaitu) Zināšanas par ādas patomehānismu ar audzēja transformāciju (n=50) un monogēnām slimībām, kas izraisa pēkšņu sirds nāvi (n=550). Ungārijas jaundzimušo vielmaiņas slimību populācijas specifiskā mutāciju paneļa noteikšana (n=30). Par Alporta sindroma attīstību atbildīgo mutāciju funkcionāla pārbaude (n=50). Metodes: Funkcionālie testi ekspresijas sistēmās un in vitro šūnu līnijās, masspektroskopiskie mērījumi un nākamās paaudzes sekvencēšanas platformas. Īstenošanas iestādes: SZTE Medicīnas ģenētikas institūts, Iekšējās medicīnas un kardioloģijas institūts Nr. 2, SZTE ÁOK Bērnu klīnikas un bērnu veselības centrs un MTA SZBK Sequencing Platform. I/2 Uzdevums 1: Funkcionāli transversāli pētījumi retos monogēna diabēta veidos (n=10 mutācijas), monogēnie sindromi (n=3 mutācijas) un monogēnu recēšanas traucējumi (n=8 mutācijas). Metodes: funkcionālie pētījumi (stabilitāte, aktivitāte, fermentācija) rekombinantās sistēmās un ādas fibroblastos. Īstenošanas iestādes: Bet Reto slimību ekspertu centrs, Klīniskās ģenētikas departaments. I/3 1. uzdevums: Ir iespējams funkcionāli anotēt jaunus gēnus neiroģenētiskajās slimībās. Metodes: tradicionālā un jaunās paaudzes sekvencēšana. Īstenošanas iestādes: Pte Medicīnas ģenētikas institūts. II. IZMAIŅAS RETO SLIMĪBU DIAGNOSTIKĀ II/1. 1. uzdevums: Jaunās paaudzes sekvencēšanas diagnostikas pa
