Eelarverealt nähakse ette vajalik toetus programmi juhtimiseks, selle rakendamiseks, järelevalveks, kontrollimiseks ja hindamiseks, korraldusasutuse, toetusesaajate ja seirekomisjoni liikmete haldussuutlikkuse suurendamiseks, et tagada rakenduskava tõhus rakendamine ning erisuutlikkus keskkonnasektori projektide ettevalmistamiseks, rakendamiseks ja juhtimiseks.