Spremembe RNK so opažene na specifičnih ostankih RNK celic in imajo ključno vlogo pri zorenju in funkcionalnosti. Od opisanih kemičnih sprememb je najbolj razširjena nukleotidna metilacija. V celici citoplazemski senzorji prepoznajo nemodificirane eksogene RNA in aktivirajo proizvodnjo interferona tipa I za vzpostavitev protivirusnega stanja. Nekatere posttranskripcijske spremembe virusne RNA, kot je sprememba m6A, ki jo najdemo pri virusih, kot sta hepatitis C in Zika, ter vplivajo na replikacijo in aktivacijo protivirusnega odziva. Med okužbami z virusi humane imunske pomanjkljivosti, herpesom, povezanim z Kaposi sarkomom in gripo, ti virusni RNA vsebujeta spremembe m6A, ki vplivajo na replikacijo virusov. Vpliv posttranskripcijskih sprememb virusne genomske RNA (gRNA) med okužbo in prirojenim imunskim odzivom še ni znan. Cilji so: (I) kartirajo spremembe RNA različnih virusov RNA (flavivirus, alfavirus, rabdovirus in pikornavirus) med virusnim ciklom; (II) določi spremembe gRNA pri biogenezi in zorenju virusnega genoma v organih človeški celici; (III) preučevanje sprememb, ugotovljenih pri prepoznavanju virusnih genomov s senzorji RLR in aktivaciji poti interferona tipa I v ciljni celici.