Obiectivul principal este de a asigura punerea în aplicare armonioasă și eficientă a programelor operaționale: POIG, POKL și POPC. POPT oferă resurse financiare pentru gestionarea proceselor din domeniul pregătirii, gestionării, punerii în aplicare, monitorizării, evaluării și controlului punerii în aplicare, precum și pentru informarea și promovarea programelor Uniunii.