FSE II la ČZU este un proiect cuprinzător care vizează îmbunătățirea calității activităților educaționale, introducerea practicii în programele de studiu, creșterea participării studenților cu SP în educație, internaționalizarea mediului ČZU, dezvoltarea legăturilor dintre absolvenții universitari în legătură cu aplicarea absolvenților pe piața muncii cu scopul de a pune în aplicare în gestionarea strategică a programelor de studiu la universitate și în continuare pe activități care conduc la creșterea interesului de a studia la ČZU din rândurile studenților. Important este legătura dintre proiect și proiectele complementare FEDR.