A resistência antimicrobiana é um grande problema de saúde pública. No âmbito de uma biomonitorização sanitária da costa da Aquitânia, propõe-se uma investigação epidemiológica da resistência aos antibióticos para documentar as relações causais entre os ecossistemas costeiros naturais selvagens e domésticos e a saúde humana. As comunidades animal e humana estão a interagir e os pontos de contacto entre o ambiente, os seres humanos e os animais são vias possíveis para a passagem de microrganismos resistentes aos agentes antimicrobianos. Como os reservatórios genéticos de resistência antimicrobiana são desconhecidos, este estudo determinará, entre outras coisas, se um determinado nicho ambiental é distinguido.