A antiga cidade de Aptera se estende até a colina de Paliokastro, a sudeste da Baía de Souda e a uma distância de cerca de 15 km da cidade de Chania. A cidade desenvolveu-se num forte centro comercial e político, devido à sua posição, no planalto da baixa colina (200 m. de altitude), ocupando uma posição estratégica acima da Baía de Souda. Por esta razão, Aptera foi caracterizada como a cidade mais comercial de Creta e durante os períodos de prosperidade, uma das mais fortes, governando uma grande área de terra que incluía muitos assentamentos rurais. O local é hoje o local mais visitado na Lei Chania. Alguns dos monumentos eram visíveis a partir do período veneziano, enquanto outros vieram à luz depois de escavações que começaram sistematicamente nos anos 80. A maioria dos edifícios do sítio arqueológico pertencem principalmente às eras helenística e romana (dois grandes tanques, dois banhos, o teatro, uma casa romana, templos, a fortificação da cidade e monumentos funerários), enquanto o mosteiro de São João, o Teólogo, na sua forma atual, é construído durante o período veneziano. A restauração e promoção do antigo teatro em 2015 também acrescentou outro importante monumento visitado ao sítio arqueológico. A regeneração do sítio visa preservar e promover o património arquitetónico, cultural e natural, uma vez que as obras visam a adequação e restauro do monumento.