Il progetto di gestione del programma operativo è concepito per garantire un'amministrazione efficiente dei fondi strutturali dell'UE. Il progetto prevede il finanziamento delle spese connesse allo svolgimento delle funzioni di amministrazione dei fondi strutturali dell'UE affidate all'Agenzia per lo sviluppo degli investimenti pubblici UAB, come previsto dalle norme per l'amministrazione dell'assistenza tecnica approvate con decreto n. 1K-337 del ministro delle Finanze della Repubblica di Lituania del 28 ottobre 2014 che approva le norme per l'amministrazione dell'assistenza tecnica.