Le CEN Nouvelle-Aquitaine est gestionnaire de nombreux sites de milieux naturels sur les PNR Périgord - Limousin et Millevaches en Limousin. Pour 23 d'entre eux qui ont une document de gestion validés, il y a besoin de temps d'animation pour mettre en oeuvre les opérations prévues, les suivre et les évaluer afin de garantir la préservation de la biodiversité qu'ils hébergent. Pour chaque site, une fiche d'activité fait le bilan des actions menées au cours de l'année et des résultats obtenus afin d'anticiper les actions à mettre en place dans l'avenir. Des suivis écologiques sont également menés pour évaluer in situ, l'état des habitats et des espèces, en menant des protocoles différents relatifs aux objectifs définis au préalable.