Les modifications de l ARN sont observées sur des résidus spécifiques des ARN cellulaires et jouent un rôle clé pour leur maturation et leur fonctionnalité. Parmi les modifications chimiques décrites, la méthylation des nucléotides est la plus abondante. Dans la cellule, les senseurs cytoplasmiques, reconnaissent les ARN exogènes non modifiés et activent la production d interféron de type I pour établir un état antiviral. Certaines modifications post-transcriptionnelles des ARN viraux comme la modification m6A retrouvée chez les virus tels que Hépatite C et Zika et affecte la réplication et l activation de la réponse antivirale. Lors d infections par les virus de l immunodéficience humaine, herpès associé au sarcome de Kaposi et grippe, ces ARN viraux contiennent des modifications m6A, affectant la réplication virale. L impact des modifications post-transcriptionnelle de l ARN génomique(ARNg) viral au cours de l infection et la réponse immunitaire innée restent à ce jour inconnue. Les objectifs sont : (i) de cartographier les modifications des ARN de différents virus à ARN (flavivirus, alphavirus, rhabdovirus et picornavirus) au cours du cycle viral; (ii) de déterminer les modifications de l ARNg sur la biogenèse et maturation du génome viral dans les organites de la cellule humaine; (iii) d étudier les modifications identifiées sur la reconnaissance des génomes viraux par les senseurs RLR et l activation de la voie des interférons de type I dans la cellule cible.