En 2017, afin d'acquérir une connaissance précise et de répondre aux demandes des collectivités travaillant sur leurs documents d'urbanisme, la CLE s'est engagée à réaliser un inventaire des zones humides sur l'ensemble de son territoire d'intervention. L'étude a pour objet de réaliser l'inventaire des zones humides identifiées comme prioritaires sur le bassin Allier aval et d'accompagner les acteurs du territoire dans la connaissance de ces milieux et sur leurs modalités de gestion. Il s'agit à terme d'améliorer les connaissances sur les zones humides en constituant un diagnostic homogène sur l'ensemble du territoire, de développer une information sur les zones humides du territoire et d'être un outil de planification et d'aide à la décision pour les acteurs de l'eau du bassin versant.