La biodiversité est fortement impactée par les activités anthropiques qui sont à l'origine de la modification du fonctionnement de nos milieux (assèchement des Zones humides, fragmentation des continuités longitudinales ou latérales des cours d'eau). La Fédération porte des actions d'acquisition d'indicateurs afin d'améliorer la connaissance sur les espèces et habitats menacés tout en contribuant à la reconquête des milieux humides dégradés et des continuités écologiques de nos cours d'eau. La réalisation d'un tel projet n'est rendue possible qu'à travers la sensibilisation du plus grand nombre à la fragilité de notre environnement et l'animation d'un réseau d'acteurs (institutionnels et gestionnaires).