El valle del Sena alberga un patrimonio natural excepcional, tanto desde el punto de vista de las especies como de los espacios. Desde las puertas de París hasta la boca, la amultitud de ambientes se han desarrollado e interactuando entre sí. Cada uno alberga hábitats y especies de alto valor ecológico, a menudo raros y amenazados, y a veces únicos.Las islas del Sena forman parte de los sistemas de aguas blandas y los entornos que se encuentran son notables para Normandía, pero más ampliamente para la Unión Europea. Algunos hábitats constituyen hábitats protegidos en virtud de la Directiva Hábitats-Faune-Flore, tales como prados de segado, embutidos arborescentes, deslizamientos de lodo y megaforbias. Estos espacios son el hogar de muchas especies vegetales y animales raras y amenazadas, algunas de las cuales están protegidas. Las islas Sena, por otro lado, tienen muchos embalses de biodiversidad (acuáticos, húmedos y arbolados), unidos por corredores ecológicos pertenecientes a varios subtramos.Aunque este patrimonio natural está ahora reconocido, sigue siendo amenazado y severamente degradado.